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外来生物对土壤微生物群落影响的脂肪酸生物标记辅助分析软件的研制

刘波  林营志  张秋芳  
【摘要】:磷脂脂肪酸(PLFAs)法是一种可用于定性和定量分析土壤微生物群落多样性的方法。本软件以Perl为开发语言,以MIDI系统的样品脂肪酸检测文件为数据源,自动提取文件脂肪酸数据,构建数据矩阵;计算批次样品的磷脂脂肪酸特征,计算Shannon-Wiener(H_1)、Brillouin(H_2)、McIntosh多样性指数(H_3)、丰富度指数(S)和Pielou均匀度(J)、Simpson优势度指数(D)等多样性指数;进而根据实验设计的平行处理和重复信息计算平均值和标准差,并调用R统计软件模块进行聚类分析和主成份分析。本软件可应用于基于磷脂脂肪酸的土壤微生物群落多样性研究,提高分析效率。

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