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正茬与重茬地黄miRNAs的差异表达谱分析

陈新建  杨艳会  许海霞  范华敏  李娟  张重义  
【摘要】:本研究利用Solexa测序技术并结合生物信息学和荧光定量(qRT-PCR)分析,首次从正茬(种植1年)地黄和重茬(种植2年)地黄中鉴定了82个保守的miRNAs(属于24个家族)和7个新型的miRNAs(属于7个家族),预测了7个新型miRNAs的15个靶基因,同时在正茬地黄和重茬地黄之间构建了miRNAs差异表达谱。结果表明:在82个保守的miRNAs中,28个miRNAs(属于11个miRNAs个家族)表达谱差异达到极显著水平;在7个新型的miRNAs中,3个miRNAs表达谱差异达到极显著水平。表达差异的miRNAs及其靶基因功能分析表明:这些靶基因参与了转录调控、信号传导、逆境生理等生物学过程,这些miRNAs及其靶基因直接或间接调控着地黄根系的生长和发育,miRNAs介导的转录后基因表达调控在连作障碍的形成过程中可能起着关键作用。本研究建立了正茬地黄与重茬地黄差异miRNAs表达谱,这为揭示miRNAs调控基因表达而引起地黄连作障的分子机制提供了重要的理论基础。

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