收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

Comparision of two sequencing methods in the complete mitochondrial genome of Epeorus sp.and the gene arrangement of Epeorus sp.

Panpan Yu  Tingting Wang  Xuefang Cheng  Yue Ma  Jiayong Zhang  
【摘要】:正Next-generation sequencing(NGS) approach via Long-Range PCR and the classical sequencing via short fragments amplification can successfully obtain the mitochondrial genome of insects.In this study,we compare two sequencing methods in Epeorus sp.(Ephemeroptera, Insecta).We found the NGS is more convenient,cheaper and faster.The complete mtDNA genome is 15,338 bp long and contains 38 genes,and all genes are similar to Parafronurus youi with extral tRNA~(Met).The nucleotide composition of the genome is highly A+T biased(64.7%).A total of 1771 bp of non-coding sequences were observed at 31 inter-genes.The overall A+T content of control region(72.7%),which is similar to other studied mayflies.All PCGs in the mitochondrial genome of Epeorus sp.initiate with the ATD start codon(ATG,ATC,ATT or ATA) and GTG,and terminated with TAA or TAG.

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 ;应用数学学报 第4卷1981总目录[J];应用数学学报;1981年04期
2 游冬青,郭光明;多聚酶链反应的原理、应用及其进展[J];癌变.畸变.突变;1990年03期
3 刘敬忠,杨国英;用直接测定基因组DNA序列的方法检测β-地中海贫血基因突变[J];中国生物化学与分子生物学报;1991年01期
4 张春发,范琦,刘淑珊,李文利,王林美,李广泽;柞蚕NPV核多角体蛋白基因核苷酸序列分析及其mRNA转录起始点的确定[J];蚕业科学;1992年02期
5 董建国,杨祥发;1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶:从酶学研究蛋白质纯化到分子克隆(英文)[J];植物生理与分子生物学学报;1992年03期
6 屠红旻,夏其昌;蛋白质和多肽 C 端氨基酸序列研究进展[J];生物化学与生物物理进展;1993年03期
7 陈晓光,刘国章,徐帆,王章,江静波;Amplification,cloning,sequencing and expression of the gene encoding the major surface antigen of Toxoplasma gondii isolated [J];中国人民解放军军医大学学报(英文版);1994年02期
8 惠宏襄,金明,韩骅,王成济;Cloning and sequencing of the fourth exon of transforming growth factor α gene[J];中国人民解放军军医大学学报(英文版);1994年03期
9 王瑛,王燕,M.威尔特,刘冬梅,李辉,贾雅丽,沈孝宙,梁志清;大麻哈鱼生长激素基因Ⅱ的分子克隆和序列分析(英文)[J];动物学报;1996年02期
10 孙宁,JohnRArrand;人6型疱疹病毒糖蛋白H基因测序与表达[J];中华微生物学和免疫学杂志;1996年03期
11 曹凯鸣,詹树萱,黄伟达,江瑛,忻骅,孙崇荣;水稻 c DNA文库的构建以及 1 0 0种随机挑取克隆部分结构的分析[J];植物学报;1996年10期
12 孙世杰;成组加工中的加工全程和延误工件数问题[J];应用数学与计算数学学报;1996年01期
13 李雷,刘松梅,胡鸢雷,林忠平;Cre/lox定位重组系统共转化烟草及其精确重组[J];科学通报;1999年21期
14 高林,汪定伟,王书宁;单一模具约束的平行机台成组工作调度方法(英文)[J];控制理论与应用;1999年06期
15 郭葆玉,张淑英,余建国,道书艳,苗红,邱磊;人单核细胞趋化蛋白受体5的基因克隆及该基因超家族成员氨基酸结构分析(英文)[J];第二军医大学学报;2000年11期
16 江树业,陈启锋,方宣钧,李维明,吴为人;植物基因分离方法及其评述[J];福建农业大学学报;2000年03期
17 何水林,郑金贵;农业生物技术在作物品质改良中的应用[J];福建农业大学学报;2000年03期
18 司昕,郑应平,安燮南;单机调度中平均流程时间和延期工件数的双目标问题[J];自动化学报;2000年03期
19 卢欣,李衍达;基因调控过程中的典型控制环节[J];自动化学报;2000年05期
20 司昕,郑应平,安燮南;具有多种工件类型的最小订单延期数问题[J];自动化学报;2000年06期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 ;TNF-a induce the F-actin arrangement and permeability increase in endothelial cells by RhoA-ERK1/2 pathway[A];第十三次全国心血管病学术会议论文集[C];2011年
2 Helene Blanche;Howard Cann;Lars Bolund;Karsten Kristiansen;;Building the sequence map of the human pan-genome[A];培育生物产业,发展绿色经济——第五届中国生物产业大会·2011基因科学与产业发展论坛会刊[C];2011年
3 Laurie Goodman;Ines Hellmann;Michael Inouye;John Pool;Karsten Kristiansen;Gane Ka-Shu Wong;Rasmus Nielsen;Richard Durbin;Lars Bolund;;The diploid genome sequence of an Asian individual[A];培育生物产业,发展绿色经济——第五届中国生物产业大会·2011基因科学与产业发展论坛会刊[C];2011年
4 ;Large-scale genome sequencing based genotyping and genome-wide association studies in rice[A];第十一届全国植物基因组学大会摘要集[C];2010年
5 ;An emerging draft sequence of the tomato genome-chromosome 3 sequencing in China[A];第十一届全国植物基因组学大会摘要集[C];2010年
6 ;A map of human genome variation from population-scale sequencing[A];培育生物产业,发展绿色经济——第五届中国生物产业大会·2011基因科学与产业发展论坛会刊[C];2011年
7 R.Stephanie Huang;;Genome-wide Discovery and Clinical Validation of Pharmacogenomic Markers for Chemotherapy[A];第十届全国化疗药理暨抗感染药理高峰论坛资料汇编[C];2010年
8 ;Resistance gene analogies (RGA) amplification in wheat genome revealed by comparative genomics and sequencing analyses[A];第十一届全国植物基因组学大会摘要集[C];2010年
9 ;Chemical Biology of Natural Products:From Genome to Drug Discovery[A];中国化学会第八届天然有机化学学术研讨会论文集[C];2010年
10 ;The Draft Genome Sequence of Ae.tauschii,the D Genome Donor of Common Wheat[A];第十二届全国植物基因组学大会论文集[C];2011年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 巴恒星;中国梅花鹿全基因组初步组装、分析及单核苷酸多态性研究[D];中国农业科学院;2012年
2 袁细国;基因组变异仿真与基因组模式鉴定[D];西安电子科技大学;2011年
3 李树;ε-聚赖氨酸产生菌的筛选、育种及发酵研究[D];江南大学;2013年
4 刘佳森;绵羊全基因组CNV与部分性状的关联分析[D];中国农业科学院;2012年
5 Vootla.Shyam Kumar;家蚕来源的一株单链RNA病毒的分离和特性研究[D];浙江大学;2004年
6 周卉卉;结直肠癌IGFBP-rP1基因甲基化调控机制研究[D];浙江大学;2010年
7 徐志刚;膀胱癌中XPC基因表达缺陷及其分子调控机制研究[D];第三军医大学;2010年
8 朱宏文;X连锁先天性全身性毛发增多症致病突变的鉴定[D];北京协和医学院;2011年
9 陈宏宇;关于部分排序的基因组重组问题的研究[D];山东大学;2011年
10 李晓然;基于核糖体RNA高通量测序分析微生物群落结构[D];复旦大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王保才;(n,k)-Star图和(n,k)-Arrangement图的反馈数[D];大连理工大学;2010年
2 王吉星;对象/关系映射在.NET平台下的研究与应用[D];吉林大学;2007年
3 高青松;基于数据降维技术的全基因组区域化关联分析统计推断方法研究[D];山东大学;2011年
4 陈松;Genome shuffling提高埃博霉素B的发酵产量[D];陕西科技大学;2013年
5 阿里;玉米大斑病菌NPS6基因的克隆和功能分析[D];吉林大学;2012年
6 默韶京;长穗偃麦草中AP2/EREBP类转录因子基因的克隆与功能验证[D];河北农业大学;2011年
7 木坤(Murugan Nigum);[D];华中科技大学;2012年
8 应璞;FTO基因多态性与中国汉族人群骨性关节炎及体重指数的关联性研究[D];南京大学;2013年
9 范春明;蛋白质的电喷雾串联质谱法分析和鉴定[D];湖南师范大学;2004年
10 盛泉虎;串联质谱蛋白质鉴定方法的研究[D];中国科学院研究生院(上海生命科学研究院);2004年
中国重要报纸全文数据库 前6条
1 李晓慧 杨鸿;The contents of an audit engagement lette[N];中国财经报;2002年
2 韦森;企业家精神与文化[N];中华读书报;2002年
3 龚华萍 樊丽 杜红丽;华大基因、华南理工科技创新班模式引关注[N];科技日报;2010年
4 记者 宦建新 通讯员 童淑娟;大黄鱼全基因组序列图谱绘制完成[N];科技日报;2011年
5 记者 易运文;蚂蚁也能进行农业生产[N];光明日报;2011年
6 通讯员 梁淡丽 记者 刘传书;科学家发现切叶蚁社会行为与特殊基因有关[N];科技日报;2011年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978