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Advances in the use of DNA barcodes to identify trees in Xishuangbanna tropical seasonal rainforest dynamics plot

慈秀芹  
【摘要】:正DNA barcoding is a technique using a or a few fragments of the genome to perform species identification,with the aim of contributing to a wide range of ecological and conservation studies in which traditional taxonomic identification is not practical,especially large-scale plant diversity inventories.We choose four regions-rbcL,matK,trnH-psbA and ITS to identify trees in 20 hectares dynamics plot of Xishuangbanna tropical seasonal rainforest In this study,we collected 719 individuals including a total of 380 morphospecies, of which 305 were determined to valid species,while 70 were identified to generic level and 5 to family level.Our results show that rbcL and trnH-psbA are easy to amplify and sequence, matk and ITS has a low rate of sequencing success(80%).In the four tested DNA regions, ITS has the most variable information,and rbcL has the least On the whole,all the markers achieved a lower rate of correct plant identification than other similar researches regardless of algorithms(neighbor joining,BLAST and TaxonDNA).Neverthless,we found some self-evident mistakes through data analysis which may be made by taxonomists in the field work.We concluded that DNA barcoding is an invaluable tool for detecting errors for identifying plants,but it is not very enough to identify species if we only rely on the tool.

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