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miRNA与水稻种子活力的相关性研究

成海兰  姜孝成  
【摘要】:基于Sanger miRBase Release11.0(http://microrna.sanger.ac.uk)公布的覆盖所有生物体miRNA的1700多个捕获探针的芯片分析,常规水稻ZR02(种子初始萌发率为98.3%)的人工老化至三个不同活力水平(萌发率分别为85.7%、52.7%、0)的种子胚中miRNA有275个呈现差异表达,表达模式可分为以下随种子活力下降而出现的四种情况:(1)表达逐步下调;(2)表达逐步上调;(3)交替上、下调表达,相比于未老化种子,表达总体水平上调;(4)交替上、下调表达,相比于未老化种子,表达总体水平下调。进一步对芯片分析得知的不同活力种子胚中表达量存在显著差异的22个miRNA进行Real-time荧光定量PCR分析,所得结果与芯片分析结果基本一致的有:miR817、miR399j、miR399d、miR395t、miR164c、miR395o、miR168a等7个。结合生物信息学的方法预测这些特异性miRNAs的靶基因及其靶基因可能的功能时,发现这些miRNA可能参与调控种子活力相关的生理代谢,从而暗示miRNA-基因(蛋白质)-种子活力之间可能存在某种联系,为深入探讨miRNA参与种子活力的调控机制提供了依据。

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