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麦洼牦牛H-FABP、HSL基因遗传多态性及与生长性状的关联分析

柴志欣  王永  罗晓林  钟金城  刘仲娜  曾贤彬  
【摘要】:麦洼牦牛作为青藏高原型牦牛的优良地方品种,主要分布于川西北地区的阿坝藏族羌族自治州、甘孜藏族自治州和甘肃省的甘南地区,是我国牦牛这一特有牛种中最早被人认识和研究的重要地方品种之一。牦牛生活在环境污染少、未施过化肥和农药的天然草场上,以天然牧草为食,其畜产品是名符其实的"绿色食品"。因此,对肉质的研究和产肉量的选育提高显得尤为重要。鉴于H-FABP、HSL基因在动物脂质生成及代谢过程中的重要调节作用,近年来通常作为影响肌内脂肪含量(IMF)和背膘厚的重要候选基因。目前,对牦牛脂肪代谢及肉质性状等经济性状的研究相对较多,而H-FABP、HSL候选基因与其他生长性状间的相关性报道却较少。通过对牦牛H-FABP、HSL基因进行SNP筛查,探讨其在牦牛内的遗传多态性,进一步揭示牦牛各品系间的遗传分化以及候选基因与牦牛生长性状间的相关作用,同时为2个候选基因在牦牛中的表达调控,获得生长性状与肉质性状选择优势等研究提供理论依据,寻找可用于辅助选择的分子标记。采用PCR-SSCP技术和DNA测序技术对麦洼牦牛(纯黑和粉嘴两个群体)共100头个体的H-FABP、HSL基因的外显子部分进行遗传多态性分析,统计基因和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算纯合度、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传多态指标,分析候选基因不同基因型与体高、体重、体斜长、胸围、管围等生长性状的关联性。结果表明:①麦洼牦牛H-FABP、HSL基因外显子部分均存在多态性,多态性检验均存在三种基因型;H-FABP基因突变位点的多态性较低(P0.25),HSL基因外显子7、8上的多态位点处于中度多态(0.25P0.5),各多态位点在麦洼牦牛2个群体中的杂合度均较高;②适合性检验表明仪HSL基因外显子8上多态位点处于:Hardy-Weinberg平衡状态,其余多念位点均偏离;③测序分析表明,H-FABP外显子4第7339位(与原序列相比)发生单碱基突变(T→C),该突变属同义突变;HSL基因外显子7第6883位发生G→C转换,以及第6816处发生碱基A→G突变,并导致编码氨基酸由天冬氨酸(D)转变为甘氨酸(G);外显子8第10183bp处发生A→G碱基突变,编码氨基酸由半胱氨酸(c)变甘氨酸(G);④对各标记基因型生长发育指标(体高、体斜长、胸围、管围、体重)进行差异显著性检验,仅HSL基因外显子7上A6816G基因座住管围中差异极显著(P0.01)。麦洼牦牛H-FABP、HSL基因存在遗传多态性,且HSL基因外显子7上A6816G基因座表现的多态有可能作为一种遗传标记,通过对优势基因型的选择,加快对牦牛育种的遗传改良。

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