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SSR标记定位于黑麦染色体上的初步研究

陈成彬  王春国  宋文芹  
【摘要】:本试验以含B染色体的黑麦为材料,利用FISH技术将SSR序列定位于黑麦A和B染色体上。根据以往文献报道,从全基因组测序数据库中选择了14个具有代表性的SSR序列进行FISH分析。结果表明在这14个SSR序列中,11个可在As、Bs上检测到杂交信号,3个未检测到杂交信号。以(AAG)_5、(GGC)_5、(ACG)_5、(AAC)_5、(CAC)_5、(CAG)_5、(AAT)_5、(AG)_8、(CA)_8、(GATA)_4为探针,FISH杂交结果显示该序列在As、Bs上具有杂交信号,只是分布的位置有所不同。只有以(AGG)_5为探针,在Bs长臂末端检测到信号,As上没有信号,降低了杂交洗脱条件后As上只有2R、3R染色体一条短臂上和4R一条长臂上有杂交信号,其他As上均没有信号出现,推测该SSR序列可能是Bs特有的重复序列。(GACA)_4、(CAT)_5、(ACT)_5在As、Bs上都未检测到杂交信号,表明此种类型的重复序列单元在黑麦基因组含量较低。上述的杂交结果表明,每个SSR序列所产生的带型还是比较稳定的,每对染色体所产生带的数量和位置基本上一致,个别有些变异可能与片段的缺失有关。不同SSR重复序列在染色体上较强的信号大部分都集中在黑麦As着丝粒附近,Bs主要集中在短臂,长臂信号比较弱,只有AGG序列在Bs长臂末端有特异信号,长臂信号相对于短臂信号比较弱。这说明As和Bs在简单重复序列组成上有一定的差别。

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