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基因组水平上受斑马鱼Smad2调控的靶基因

刘昭廷  王强  孟安明  
【摘要】:我们通过Chip-chip技术在基因组水平鉴定了斑马鱼原肠早期(胚层形成与分化的关键时期)Noda1/Smad2的靶基因,并通过表达谱芯片系统检测了Noda1信号对这些靶基因的表达调控。然后系统分析了Smad2结合位点在靶基因的分布情况及特点,重点分析了Smad2对efnb2b表达调控的分子机制。最后,通过生物信息学分析Smad2结合位点邻近的序列,我们发现许多转录因子可能作为共转录因子,与Smad2一起调控基因转录。β-catenin可以与Smad2协同促进一些基因在胚胎背部组织者表达,而Oct1和Gata6参与了Noda1/Smad2对中胚层和内胚层形成的诱导。

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