收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

Network-based terms enhanced combinatorial scoring for protein-protein docking

杨峰  李春华  常珊  陈慰祖  王存新  
【摘要】:正Residue networks are constructed by defining the residues as the vertices and atom contacts between them as the edges.The residue network of a protein complex is divided into two types of networks,i.e.the hydrophobic and the hydrophilic residue networks.By analyzing the network parameters,it is found that the correct binding complex conformations are of both higher sum of the interface degree values and lower characteristic path length than those incorrect ones.These features reflect that the correct binding complex conformations have better geometric and/or residue type

知网文化
【相似文献】
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 杨峰;李春华;常珊;陈慰祖;王存新;;Network-based terms enhanced combinatorial scoring for protein-protein docking[A];第四届全国生物信息学与系统生物学学术大会论文集[C];2010年
2 ;Conformational Changes of Protein Adsorbed on Tailored Flat Substrates with Different Chemistries[A];第十六届全国光散射学术会议论文摘要集[C];2011年
3 赵小庆;李宏;杨林源;;Interaction Form between Splided Introns and Corresponding Protein Coding Sequences of Ribosomal Protein Genes in C.elegans[A];第四届全国生物信息学与系统生物学学术大会论文集[C];2010年
4 白红军;;Predicting kinetic constants of protein-protein interactions based on structural properties[A];第一届全国生物物理化学会议暨生物物理化学发展战略研讨会论文摘要集[C];2010年
5 ;The protein translocase family YidC/Oxa/Alb3:Phylogenetic Distribution and Evolution in the Three Domains of Life[A];第三届细胞结构与功能的信号基础研讨会论文摘要[C];2010年
6 苏计国;许先进;陈慰祖;王存新;;Role of electrostatic interactions for the stability and folding behavior of cold shock protein[A];第四届全国生物信息学与系统生物学学术大会论文集[C];2010年
7 苏煜;孙之荣;;A web server for the binding affinity prediction of protein-protein complexes[A];第四届全国生物信息学与系统生物学学术大会论文集[C];2010年
8 赵绍伟;;The conserved function of LAMMER protein kinases at the mitosis-to-meiosis transition in Drosophila spermatogenesis[A];第二届模式生物与人类健康研讨会会议论文集[C];2012年
9 ;Phosphorylation and function of eIF4B protein are regulated by PIM kinase family[A];“细胞活动 生命活力”——中国细胞生物学学会全体会员代表大会暨第十二次学术大会论文摘要集[C];2011年
10 ;An Essential Role of Nucleolar Protein N in Maintaining Self-renewal of Mouse Embryonic Stem Cells[A];第三届细胞结构与功能的信号基础研讨会论文摘要[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 季永运;蛋白质折叠及其误折叠病问题的简单模型研究[D];浙江大学;2006年
2 耿燕;Fstll对于出生时肺的成熟起至关重要的作用[D];南京大学;2011年
3 张文羿;益生菌Lactobacillus casei Zhang全基因组序列的测定及比较分析[D];内蒙古农业大学;2010年
4 柏映国;脂环酸芽孢杆菌(Alicyclobacillus sp.A4)部分糖基水解酶研究及其基因组序列初步分析[D];中国农业科学院;2010年
5 丁亚丽;EDAG调控造血细胞分化的分子机制研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2010年
6 常翠芳;大鼠再生肝中星形细胞的基因表达谱分析[D];新疆大学;2011年
7 尉研;猪链球菌2型二元调控系统2148hk/rr的研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2011年
8 宫彬彬;N-端23-30位氨基酸对朊蛋白胞吞、抗氧化功能及繁殖影响的研究[D];吉林大学;2011年
9 李实骞;氧化固醇结合蛋白家族相互作用蛋白组的鉴定和功能研究[D];暨南大学;2010年
10 殷昊;植物嫁接体的发育:接口融合过程的时期划分、表达谱分析及相关基因的鉴定[D];兰州大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 SEYNI YANSAMBOU Mahamadou;[D];华中师范大学;2012年
2 安明岩;链球菌蛋白G的构建、重组表达及鉴定[D];华东理工大学;2011年
3 张旭;集胞藻PCC6803中蛋白酶Slr0643的功能分析[D];华南理工大学;2012年
4 朱宁;Acidiphilium DX1-1细胞膜蛋白质表达谱构建[D];中南大学;2010年
5 权宁文;蛋白质Myo X与GNB2相互作用研究[D];东北师范大学;2012年
6 唐秀;重组金黄色葡萄球菌蛋白A的制备性质研究与应用[D];华东理工大学;2012年
7 那第尔;识别蛋白质相互作用网络中的复合物[D];中南大学;2012年
8 徐杰;布鲁氏菌蛋白芯片的研制及抗体谱分析[D];兰州大学;2010年
9 李召春;沙冬青逆境转录表达谱的建立及分析[D];中国农业科学院;2010年
10 刁小龙;鸡PrP结构特征及在鸡胚发育过程中的表达规律[D];甘肃农业大学;2010年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978