多头带绦虫miRNA测序研究

【摘要】：本研究利用illumina深度测序技术,对从多头带绦虫(Taenia multiceps)成虫进行测序,经过处理,共得到12,820,207(96.91%)条sRNA序列,其中有2,266,539条(17.68%)能够匹配上多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis)基因组。一共有5,172,898条(40.35%)miRNA,得到170,888条(12.39%)unique sRNA。通过与miRBase16.0中所有动物的miRNA序列进行比对,得出1007个已知miRNA序列,表达量较高的两个家族是miR-71以及miR-2840,其中91个已知miRNA为miRNA前体,如miR-133a*。利用Mireap软件预测候选miRNA,种数为44种,总表达量为16,886。同时对已知miRNA做了靶基因预测,其靶基因位点数量为42,5431个。此外,还对其做了GO富集分析以及KEGG通路分析。

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中国期刊全文数据库

前20条

1	杨文闯;刘长军;刘芳萍;赵洪海;;缺失部分miRNA的重组马立克氏病病毒致病性研究[J];中国家禽;2011年04期
2	许橙;薛文志;赵茂鑫;陈信;刘颖;于汪洋;许艳丽;马腾壑;高妍;张嘉保;袁宝;;miRNA-181b在牛腺垂体中的表达规律及其调控作用研究(英文)[J];Agricultural Science & Technology;2011年07期
3	张鑫宇;何玲;袁维峰;孙怀昌;;miRNA干扰gM基因对马立克氏病病毒体外复制的抑制作用[J];中国动物传染病学报;2009年02期
4	杨文闯;刘长军;张艳萍;李志杰;张锋;侯广玉;丛锋;;马立克氏病病毒miRNA缺失株的构建及其体外生长规律[J];中国兽医科学;2011年04期
5	陈燕梅;连玲;曲鲁江;刘长军;杨宁;;茎环RT-PCR检测马立克氏病毒感染鸡相关miRNA方法的建立[J];中国家禽;2011年09期
6	袁婷婷;熊义;纪怡冰;郑从义;屈三甫;李勇;黄旋;;miRNA干扰口蹄疫病毒基因组早期复制的初步研究[J];氨基酸和生物资源;2009年02期
7	罗俊;滕蔓;樊剑鸣;王方雨;周玲;邓瑞广;张改平;;马立克氏病病毒编码的microRNA:从基因组学到功能研究[J];中国科学:生命科学;2010年06期
8	万中英;佟慧丽;李庆章;高学军;;中药王不留行增乳活性单体及催乳素对奶牛乳腺上皮细胞特异性miRNA的影响[J];中国畜牧兽医;2010年08期
9	王永娟;崔平福;孙怀昌;;靶向传染性法氏囊病病毒(IBDV)VP2有效miRNA的筛选[J];江苏农业学报;2010年06期
10	许橙;薛文志;赵茂鑫;陈信;刘颖;于汪洋;许艳丽;马腾壑;高妍;张嘉保;袁宝;;miRNA-181b在牛腺垂体中的表达规律及其调控作用研究[J];安徽农业科学;2011年20期
11	田青;;奶牛miRNA的研究进展[J];中国乳品工业;2011年09期
12	王永娟;朱善元;崔平福;;禽源细胞中miRNA表达方法建立及基因沉默效率检测[J];江苏农业科学;2010年06期
13	沈鹏鹏;王永娟;孙怀昌;张鑫宇;夏晓莉;;重组禽腺联病毒介导的miRNA抑制传染性法氏囊病病毒在鸡胚内的复制[J];微生物学报;2011年02期
14	黄潘;龚炎长;彭秀丽;李世军;杨宇;王晓;俸艳萍;;鸡胚性分化早期性别差异表达miRNAs的表达谱分析[J];农业生物技术学报;2010年06期
15	穆松;钟金城;陈智华;徐利娟;;牛基因组中新的microRNA预测及分析[J];中国草食动物;2010年01期
16	李志敏;丁福先;;MicroRNA与动物病毒性疾病研究进展[J];动物医学进展;2008年03期
17	党文庆;张立凡;徐宁迎;王颖;蔡兆伟;翟继鹏;吕尊周;郝柱;;金华猪和大约克猪分娩后21d乳腺microRNAs的预测和差异研究[J];农业生物技术学报;2011年05期
18	李仲连;;杀死牛肉带绦虫囊尾蚴的冷冻时间与温度[J];青海畜牧兽医杂志;1980年03期
19	刘滋泽;田生珠;忠拉;公保;杨隆寿;杨措;;班玛地区狗绦虫的调查[J];青海畜牧兽医杂志;1985年06期
20	王安;王海鹰;郭秀芬;额尔敦仓;乌云格日乐;沈维力;;内蒙古呼盟林牧区野狼寄生蠕虫调查报告[J];内蒙古兽医;1996年02期

中国重要会议论文全文数据库

前10条

1	吴徐行;付彦;杨德英;谢跃;古小彬;王淑贤;杨光友;;多头带绦虫miRNA测序研究[A];中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第六次代表大会暨第十一次学术研讨会论文集[C];2011年
2	付彦;吴徐行;杨德英;谢跃;古小彬;王淑贤;杨光友;;犬恶丝虫成虫miRNA的研究[A];中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第六次代表大会暨第十一次学术研讨会论文集[C];2011年
3	王星果;郁建锋;龚道清;顾志良;;鸡脂肪组织和骨骼肌miRNA的筛选和表达研究[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
4	李虹仪;习欠云;江青艳;张永亮;;猪垂体miRNA的表达分析与验证[A];全国动物生理生化第十一次学术交流会论文摘要汇编[C];2010年
5	李虹仪;习欠云;江青艳;张永亮;;不同品种猪肌肉与脂肪组织miRNA的分析比较[A];全国动物生理生化第十一次学术交流会论文摘要汇编[C];2010年
6	杨文闯;刘长军;张艳萍;张锋;侯广玉;丛锋;许娜娜;;一株马立克氏病毒miRNA缺失株的构建及鉴定[A];中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第八次学术研讨会论文集[C];2010年
7	赫晓燕;郝欢庆;范瑞文;刘丹丹;曹靖;朱芷葳;董彦君;邢海权;;成年羊驼不同部位皮肤组织中miRNA差异表达研究[A];中国畜牧兽医学会动物解剖学及组织胚胎学分会第十六次学术研讨会论文集[C];2010年
8	李红梅;尚辉琴;谢青梅;舒鼎铭;薛春宜;陈峰;曹永长;毕英佐;;J亚型禽白血病肿瘤发生发展相关的miRNA及mRNA的鉴定和功能分析[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十五次学术研讨会论文集[C];2010年
9	张在平;马学恩;杨海彦;田进;孟庆文;;靶向pol基因miRNA抑制禽白血病病毒复制的研究[A];中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第八次学术研讨会论文集[C];2010年
10	穆松;钟金城;陈智华;徐利娟;;牛基因组中新的microRNA预测及分析[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年

中国博士学位论文全文数据库

前10条

1	盛熙晖;应用文库构建法和生物信息学方法鉴定绵羊microRNA[D];中国农业科学院;2010年
2	康丽;鸡卵泡发育相关基因和miRNA的鉴定及功能分析[D];山东农业大学;2009年
3	陈兆国;上海地区动物隐孢子虫病分子流行病学调查及微小隐孢子虫miRNA的初步鉴定[D];中国农业科学院;2011年
4	李国喜;猪脂肪组织发育相关miRNA的鉴定及miR-103生物学功能的初步研究[D];西北农林科技大学;2011年
5	马腾壑;牛黄体不同发育期差异miRNA表达谱构建及miR-378在黄体细胞中的功能研究[D];吉林大学;2012年
6	徐铮;调控抗病毒天然免疫的miRNA筛选及其作用机制研究[D];华中农业大学;2012年
7	罗宗刚;猪不同发育阶段microRNA转录组的鉴定[D];四川农业大学;2011年
8	刘晓雷;旋毛虫转录组学研究[D];吉林大学;2012年
9	徐明;马立克氏病病毒诱导的免疫应答基因表达谱及miRNA对肿瘤发生的调节作用[D];吉林大学;2011年
10	廉传江;猪睾丸组织microRNA的鉴定与差异表达研究[D];吉林大学;2011年

中国硕士学位论文全文数据库

前10条

1	周鹏方;猪和甲型流感病毒microRNA预测软件系统[D];西北农林科技大学;2010年
2	宁小敏;miR-196a对猪脂肪细胞增殖分化的影响[D];西北农林科技大学;2010年
3	古维刚;猪X-linked miRNA的表达模式的研究[D];四川农业大学;2011年
4	王星果;鸡脂肪组织和骨骼肌miRNA的筛选和表达研究[D];苏州大学;2010年
5	牟志霞;miRNA体外干扰肌肉生长抑制素基因的研究[D];扬州大学;2011年
6	薛文仲;甲型H1N1流感病毒介导小鼠肺炎的相关miRNA的筛选与功能分析[D];中国人民解放军军事医学科学院;2012年
7	胡健;甲型H1N1流感病毒感染A549细胞系过程中相关miRNA的筛选与功能分析[D];西北农林科技大学;2011年
8	张飞;鸡microRNA新基因预测与检索自动化软件系统及Web可视化[D];西北农林科技大学;2011年
9	罗立凡;猪性成熟前后睾丸组织差异表达miRNA鉴定及功能分析[D];华中农业大学;2010年
10	潘英姿;肉鸡铬代谢相关miRNA的鉴定与分析[D];华中农业大学;2012年

中国重要报纸全文数据库

前4条

1	袁炎长;兽药的正确使用[N];山西科技报;2005年
2	薛志成;家兔寄生虫病的防治[N];福建科技报;2005年
3	;牛病（21）脑包虫病[N];江苏科技报;2002年
4	李书案;初秋谨防家禽蠕虫病[N];山西科技报;2004年

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