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多头带绦虫miRNA测序研究

吴徐行  付彦  杨德英  谢跃  古小彬  王淑贤  杨光友  
【摘要】:本研究利用illumina深度测序技术,对从多头带绦虫(Taenia multiceps)成虫进行测序,经过处理,共得到12,820,207(96.91%)条sRNA序列,其中有2,266,539条(17.68%)能够匹配上多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis)基因组。一共有5,172,898条(40.35%)miRNA,得到170,888条(12.39%)unique sRNA。通过与miRBase16.0中所有动物的miRNA序列进行比对,得出1007个已知miRNA序列,表达量较高的两个家族是miR-71以及miR-2840,其中91个已知miRNA为miRNA前体,如miR-133a*。利用Mireap软件预测候选miRNA,种数为44种,总表达量为16,886。同时对已知miRNA做了靶基因预测,其靶基因位点数量为42,5431个。此外,还对其做了GO富集分析以及KEGG通路分析。

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