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PCR-DGGE技术在水牛瘤胃产甲烷古菌多样性探索中的应用

刘园园  王士长  
【摘要】:采集16头广西本地沼泽型水牛瘤胃内容物,提取总DNA,利用产甲烷古菌通用引物扩增I6SrRNA基因序列,进行DGGE分析。将DGGE凝胶上7条优势条带进行回收克隆测序,得到9条序列,其中3条与甲烷短杆菌(Methanobrevibacter)的同源性也高达99%。1条与甲烷短杆菌的同源性达98%,1条序列与广古菌门(Euryarchaeota)热原体目(Thermoplasmatales)的同源性达98%。另外,有4条是和古菌存在序列相似性的未培养细菌,分别属于拟杆菌(Bacteroidetes),厚壁菌(Firmicutes),变形菌门(Proteobacteria.),几个细菌门类之间无太大同源性。

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