收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)VP1基因的扩增与生物信息学分析

赵武  李斌  梁家幸  梁保忠  白安斌  姚瑞英  黄安国  何颖  蒋玉雯  
【摘要】:对猪细小病毒自然弱毒PPV-N株VP1基因扩增及测序,利用生物信息学技术预测VP1蛋白的二级结构与B细胞抗原表位以及分析该蛋白的氨基酸差异位点及密码子偏爱性.结果表明,PPV-N株VP1基因与弱毒参考毒株NADL-2VP1基因同源性最高,亲缘关系最近,为PPV-N株和NADL-2株同属弱毒株提供了分子生物学依据.PPV-N株VP1蛋白的二级结构较为复杂,以β-折叠为主,并有较多的转角和无规则卷曲区域,在序列的20-56,61-80,86-130,136-188区域为B细胞抗原表位的优势区域.PPV强、弱毒株VP1蛋白存在5个氨基酸差异位点(T-365-I,G-528-D,Q-533-H,P-586-S,K-715-R),这些位点处氨基酸残基抗原性与毒力成正相关.PPV-N株VP1蛋白在A、C、E、G、H、I、K、N、Q、R、S、T、V和Y氨基酸于密码子选择上存在一定的偏爱性.

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 朱晶晶;魏玉荣;符子华;易忠;;口蹄疫病毒VP1基因研究进展[J];动物医学进展;2008年07期
2 马强;张二芹;张同旭;;禽脑脊髓炎病毒VP1基因植物表达载体的构建[J];华北农学报;2010年05期
3 李爽;袁宝;肖书奇;任文陟;张嘉保;赵志辉;雍海平;;猫细小病毒CC-1株VP1基因克隆与序列分析[J];中国畜牧兽医;2008年08期
4 苏春霞;段相国;张艳丽;摆茹;陈溥言;;口蹄疫病毒VP1基因重组腺病毒的构建与鉴定[J];宁夏医科大学学报;2009年05期
5 杨彬,刘在新,胡永浩,谢庆阁;口蹄疫病毒结构蛋白VP1基因的克隆及其在大肠埃希氏菌中的表达[J];中国兽医科技;2003年03期
6 毛乃颖,许文波,杨秀惠,刘中华,严延生,潘伟毅,张勇;肠道病毒ECHO_(13)中国分离株的基因特征[J];病毒学报;2004年04期
7 赵铁强,周为民,李伯军,段淑敏,张素香,赵新生,温瑞福,梁瑛娟,皮国华;柯萨奇B1病毒VP1基因序列分析[J];中华实验和临床病毒学杂志;2002年01期
8 潘丽;张永光;王永录;方玉珍;蒋守田;王宝琴;王文秀;王炜;孙元;吕建亮;谢庆阁;;口蹄疫病毒VP1基因在转基因拟南芥种子中的表达及活性检测[J];畜牧兽医学报;2006年05期
9 凌连军;张培君;李永清;龚玉梅;;O型口蹄疫病毒VP1基因的克隆及原核表达载体构建[J];动物医学进展;2006年08期
10 李浩波;马静云;李大旭;王玲玲;谢青梅;毕英佐;;3株O型FMDV VP1基因的克隆与序列分析[J];动物医学进展;2008年04期
11 黄冬艳;杨兵;齐欣;陈小玲;徐福洲;;鸡贫血病毒VP1基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达[J];华北农学报;2006年05期
12 姜向阳;邓小敏;王晶钰;王学艳;罗艳;;牛轮状病毒的分离及其RT-PCR鉴定[J];西北农业学报;2007年04期
13 何继军;尚佑军;陈涓;马维民;杨亚民;吴润;刘湘涛;;三株牛源亚洲1型口蹄疫病毒VP1基因的克隆与序列分析[J];生物技术通报;2009年04期
14 王海烽;易忠;魏玉荣;胡尔马西;符子华;;O型口蹄疫病毒VP1基因在2种原核表达载体上的表达[J];中国畜牧兽医;2009年10期
15 张怡明;罗学辉;张建群;高红;;2008年余姚市肠道病毒71型检测与VP1基因特征分析[J];中国预防医学杂志;2010年06期
16 李薇;赵祖波;李建强;程瑞霞;王军;王智永;张晓宇;王玉琳;;肠道病毒71型Lanzhou01株的分离及其生物学特性[J];中国生物制品学杂志;2010年12期
17 相磊;章振华;胡国良;陈小玲;梁之昶;徐福洲;石岗;;O型口蹄疫病毒VP1基因区序列系统发育树分型[J];动物医学进展;2007年03期
18 董志强;张志;李晓成;陈德坤;洪军;张燕霞;黄保续;;口蹄疫病毒VP1基因的克隆及结构蛋白VP1的原核表达[J];中国动物检疫;2007年02期
19 王平;阎强;孙树汉;陈明勇;;O型口蹄疫病毒结构蛋白VP1基因的克隆与原核表达[J];动物医学进展;2007年04期
20 罗玉均;张桂红;陈建红;徐小芹;廖明;张济培;;Ⅰ型鸭肝炎病毒R株VP1基因克隆与序列分析[J];广东畜牧兽医科技;2007年05期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 赵武;李斌;梁家幸;梁保忠;白安斌;姚瑞英;黄安国;何颖;蒋玉雯;;猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)VP1基因的扩增与生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集(上册)[C];2009年
2 白安斌;李斌;梁家幸;保忠;姚瑞英;黄安国;杜坚;陈西宁;卢树莲;赵武;蒋玉雯;;猪细小病毒自然弱毒N株结构蛋白VP1基因的扩增及序列分析[A];中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第三届猪病防控学术研讨会论文集[C];2008年
3 黄桂菊;罗满林;刘镇明;贺东生;耿忠海;;猪口蹄疫病毒VP1基因和免疫串联片段F的克隆及其在Vero细胞中的表达[A];人畜共患传染病防治研究新成果汇编[C];2004年
4 韩松;金宁一;鲁会军;;O型口蹄疫病毒中国株、泛亚株VP1基因的克隆与原核表达[A];人畜共患传染病防治研究新成果汇编[C];2004年
5 沈政;;口蹄疫病毒持续感染分离物VP1基因克隆及测序[A];中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第十一次兽医病理学、第十次动物病理生理学学术研讨会论文集[C];2001年
6 刘棋;金宁一;郑敏;郭建刚;李华明;兰彬;邹联斌;邓朝阳;;两株不同基因型的O型口蹄疫病毒VP1基因的克隆及表达[A];人畜共患传染病防治研究新成果汇编[C];2004年
7 钱平;陈焕春;李祥敏;金梅林;何启盖;顾贫;洪琦;;口蹄疫病毒VP1基因抗原表位在大肠杆菌中的表达[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会成立20周年庆典暨第十次学术研讨会论文集(上)[C];2003年
8 郑敏;金宁一;鲁会军;韩松;金扩世;李昌;;O型口蹄疫病毒VP1嵌合基因的构建及原核表达[A];人畜共患传染病防治研究新成果汇编[C];2004年
9 盖新娜;杨汉春;郭鑫;陈艳红;查振林;;猪脑心肌炎病毒分离毒株VP1和3D基因的序列分析[A];第一届中国养猪生产和疾病控制技术大会——2005中国畜牧兽医学会学术年会论文集[C];2005年
10 辛英豪;李莎莎;高继明;刘标;姜世金;;Ⅰ型鸭肝炎病毒VP1基因的克隆与原核表达[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集(下册)[C];2009年
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 吴雨霞;口蹄疫病毒结构蛋白VP1基因在原核和真核细胞中的表达[D];甘肃农业大学;2003年
2 徐娟;肠道病毒EV71 VP1基因的优化和免疫原性的研究[D];南京医科大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘进;口蹄疫病毒VP1基因的克隆表达及细胞因子检测研究[D];新疆农业大学;2003年
2 寇铮;鹦鹉幼雏病病毒全序列分析及VP1基因克隆与表达[D];华中农业大学;2004年
3 王钢;口蹄疫病毒VP1基因的序列分析及巢式PCR检测研究[D];四川农业大学;2005年
4 裴仉福;A型口蹄疫病毒结构蛋白VP_1基因的克隆及其在E.coli中的表达[D];甘肃农业大学;2004年
5 马秋明;牛病毒性腹泻病毒陕西株的分离与NS_(5B)基因序列测定[D];西北农林科技大学;2008年
6 陈希;鹅细小病毒常州株NS1和VP1基因序列分析及NS1基因的表达[D];扬州大学;2007年
7 蔺晓忠;密码子优化的O型口蹄疫病毒VPI基因转化饲草玉米的高效表达载体构建[D];甘肃农业大学;2007年
8 裴宗飞;鸭病毒性肝炎C3d新型分子佐剂基因疫苗的研究[D];山东农业大学;2009年
9 李伟;柯萨奇病毒B3 VP1蛋白的原核表达及免疫效果观察[D];河北医科大学;2008年
10 李杰;口蹄疫病毒VP1基因转染树突状细胞对T淋巴细胞的活化作用研究[D];河北农业大学;2009年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978