收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

单核苷酸多态性及其检测方法

邓艳  魏冬霞  朱兴全  
【摘要】:单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)是指一些物种的正常个体的基因组DNA 中单碱基对位置存在序列的变异(等位基因)。作为第三代遗传标记,它具有数量多,分布广泛,密度高,遗传稳定性等特点,适于快速、高通量检出,易实现分析的自动化。SNP 的检测技术按其研究对象主要分为两大类,即对未知的SNP 进行分析和对已知SNP 进行分析。它的检测方法主要包括以下几种:1、基于构象的SNP 检测方法,包括温度梯度凝胶电泳、变性梯度凝胶电泳、单链构象多态性和变性-高效液相色谱法等方法。变性-高效液相色谱法是一项在SSCP 和DGGE 基础上发展起来的检测SNP 的突变技术。基于构象的SNP 检测方法可以简单快速确定目标基因片段中是否存在突变:其缺点是不能给出序列信息,因而无法确定具体突变位点与突变形式,不能对一个SNP片段中的多个突变加以区分;对操作者技术要求较高。2、基于单碱基变异对核酸分子杂交产生影响的方法,包括等位基因特异寡核苷酸片段分析、基因芯片技术和毛细管电泳技术。在等位基因特异寡核苷酸片段分析的基础上,发展了分子信标和TaqMan 技术。基因芯片具有信息量大和自动化程度高的突出优点。但芯片造价高昂,所需设备贵重,不利于普及应用。毛细管电泳省时、省力,能在20分钟之内分离长至数千的碱基片段,还可以同时处理多个样品,相对减少操作时间及工作量,而且适合于自动化的要求。3、引物延伸方法,其原理类似于微型测序方法,目前主要有SNP shot~(TM)GeneScan 和TDI-FP.4、直接测定单碱基变异对核酸分子量所造成的改变的方法,主要指质谱技术。质谱技术直接检测被测物本身的一个物理量一分子量,因而是最直接最可靠的方法。此法具有准确、快速、耗费低、谱图简单、直观等特点。另外,还可以同时对多个SNP 位点进行分析,这些都大大降低了耗费,具有自动化和高通量的潜能。近年来在寄生虫领域研究SNP 的主要有恶性疟原虫、肿孔古柏线虫、弓形体和球虫,研究包括基因作图、基因定位、物种鉴定等领域。SNP 标记可用于研究恶性疟原虫的起源和疟原虫表面抗原基因的多态性。对肿孔古柏线虫研究可以用来决定肿孔古柏线虫的种群遗传结构,最终用于了解寄生虫和宿主的关系。弓形体的SNP 研究可用于基因作图。另外,用带SNP 的引物可以用来分辨环孢子虫(C.cayetanensis)和艾美尔属球虫。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 桑春燕;闫玥;;舒巴坦钠相关物质高效液相色谱分析[J];黑龙江科技信息;2009年07期
2 孔凡洲;徐子钧;于仁成;李钦亮;;黄渤海海域贝类麻痹性贝毒的检测与分析[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2007年02期
3 张开庆;梁勇;彭翠琳;;黑米高效液相色谱指纹图谱研究[J];华南师范大学学报(自然科学版);2009年02期
4 张秀珍;张世娟;宫向红;徐英江;于召强;邹荣婕;李佳薇;;雌激素对水生生物的影响及其检测方法研究进展[J];海洋湖沼通报;2010年03期
5 吴兆蕃;;黄曲霉毒素的研究进展[J];甘肃科技;2010年18期
6 汪世华;张峰;袁军;张薇;刘晓雷;王磊;;生物毒素检测技术新进展[J];应用与环境生物学报;2008年05期
7 易勇;夏立秋;丁学知;杨尉;王海龙;罗玉双;;高效液相色谱法测定刺糖多胞菌发酵液多杀菌素含量[J];湖南师范大学自然科学学报;2008年04期
8 张会军;张敬轩;李挥;张岩;;固相萃取-高效液相色谱法同时检测化妆品中14种邻苯二甲酸酯[J];河北省科学院学报;2010年01期
9 刘如铟;何培新;;忍冬藤中绿原酸的含量测定[J];河南科学;2006年01期
10 朱俊德;龚明;;老年大鼠松果体中褪黑素含量的测定[J];四川解剖学杂志;2006年04期
11 彭俊清;郑穹;段建利;;马来酸噻吗洛尔眼用凝胶剂的含量测定及药效研究[J];武汉大学学报(理学版);2005年S2期
12 吕换地;史奕;张景;王芳;尹书芳;;黄连中盐酸小檗碱含量检验方法的对比与研究[J];科技信息(科学教研);2007年17期
13 吴北辰;;乳制品、饲料中三聚氰胺的检测方法及思考[J];科技资讯;2009年14期
14 梁红;李树华;林峰桦;朱昌权;刘自力;;鱼罐头中油组分对孔雀石绿高效液相色谱检测结果的影响[J];广州大学学报(自然科学版);2010年04期
15 尹柏双;高利;张帆;;RP-HPLC法检测大鼠海马中4种氨基酸类神经递质含量的研究[J];河南农业科学;2009年05期
16 张明;冯璐璐;;抗氧化活性评价标准与发展[J];安徽农学通报(下半月刊);2010年08期
17 黄红兵;刘韬;邓多;周峰;林子超;陈倩超;陈杰;赵立子;毕惠嫦;;以睾酮为探针测定大鼠CYP3A酶活性的实验研究[J];中国现代应用药学;2008年05期
18 柴玉莲;;仪器分析在《中国药典》中的应用[J];西藏科技;2006年01期
19 吴节莉;孔祥泰;;禁用偶氮染料检测方法探讨[J];实验室研究与探索;2010年02期
20 王秀东;马英;邹洪;;蓝色圆珠笔油墨的HPLC鉴别[J];北京教育学院学报(自然科学版);2006年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 林凌云;李慧;许崇涛;;高效液相色谱-荧光检测法测定大鼠脑组织单胺类神经递质及相关物质[A];中华医学会精神病学分会第七届学术年会论文摘要集[C];2006年
2 杜继红;周德刚;孙志文;;氯霉素残留检测方法研究综述[A];首届中国兽药大会动物药品学暨中国畜牧兽医学会动物药品学分会2008学术年会论文集[C];2008年
3 李国成;刘春霞;余晓霞;林晓珊;;HPLC测定鼻炎灵滴鼻液中盐酸萘甲唑林和马来酸氯苯那敏含量[A];2010年广东省药师周大会论文集[C];2011年
4 申丽静;汪钊;;生物类黄酮含量检测方法的研究进展[A];第一届全国化学工程与生物化工年会论文摘要集(下)[C];2004年
5 张志强;江英;田丽萍;;高效液相色谱-二极管阵列检测法测定食品中的辣椒红色素[A];中国化学会第二十五届学术年会论文摘要集(下册)[C];2006年
6 徐建陶;陈文明;孙定炜;;高效液相色谱法在农药残留分析中的应用[A];华东地区农学会学术年会暨福建省科协第七届学术年会农业分会场论文集[C];2007年
7 赵俊;陈祥峰;唐燕平;;HPLC法测定注射用雷贝拉唑钠的含量及有关物质[A];2008年《药物分析杂志》第三届普析通用杯论文集[C];2008年
8 唐虹;汪冀;王延琦;夏宝清;严川信;王丽;;作业场所空气中奥克托今适应TWA监测检验方法研究[A];第十五次全国色谱学术报告会文集(下册)[C];2005年
9 黄芳;黄晓兰;林晓珊;吴惠勤;;HPLC法测定纺织品中八种致敏禁用染料[A];第十五次全国色谱学术报告会文集(下册)[C];2005年
10 王京辉;杜小伟;王萌萌;张小茜;荆芳;房秀霞;王海涛;王连喜;石任宾;;舒血宁注射液及银杏叶提取物、银杏叶指纹图谱研究[A];2006年全国药物质量分析学术研讨会——《药物分析杂志》第二届普析通用杯优秀论文评选颁奖会论文集[C];2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 赵春霞;基因序列变异分析的方法研究及其临床应用[D];中国科学院研究生院(大连化学物理研究所);2004年
2 孟祥艳;牛肉物理特性与品质的检测方法研究[D];吉林大学;2010年
3 赵正保;抗肠源性内毒素药物《双利肝》的药学研究[D];山西医科大学;2005年
4 孙秀兰;食品中黄曲霉毒素B_1金标免疫层析检测方法研究[D];江南大学;2005年
5 王威;大鼠下颌骨成骨细胞对格列本脲和胰岛素的转运[D];中国人民解放军军医进修学院;2007年
6 耿红梅;欧亚旋覆花中黄酮类化合物的研究[D];河北医科大学;2007年
7 林岭;运动性心理疲劳的概念模型、多维检测、影响因素及干预措施[D];北京体育大学;2006年
8 马昌杯;分子信标技术在生物酶和ATP等重要生物分子检测中的应用[D];湖南大学;2007年
9 魏世明;岩体变形光纤光栅传感检测的理论与方法研究[D];西安科技大学;2008年
10 刘桂英;人参叶化学成分及其生物活性研究[D];吉林大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王尧尧;功能食品中西地那非酶联免疫检测方法的研究[D];天津科技大学;2009年
2 周正华;高效液相色谱法测定D-泛酸钙含量的方法研究[D];山东大学;2007年
3 林楠;乳及乳制品中残留青霉素钾酶解产物检测方法的研究[D];内蒙古农业大学;2008年
4 江凌;万古霉素高产菌株的选育研究[D];天津科技大学;2005年
5 邵丽华;食品和保健品中水溶性维生素的检测方法及应用研究[D];山东大学;2008年
6 李健;三术克异汤的质量标准与急性毒性研究[D];青岛大学;2004年
7 庄江兴;HPLC在药物检测中的应用[D];吉林大学;2005年
8 余斌;大鼠移植肝中ATP含量与术后早期功能的关系[D];苏州大学;2005年
9 崔美花;八种药用植物化学指纹图谱的初步研究[D];西南交通大学;2006年
10 王丽霞;保护地邻苯二甲酸酯污染的研究[D];山东农业大学;2007年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 张秀萍;WADA寻求EPO简易检测方法[N];中国体育报;2001年
2 国家外来运动疫病诊断中心 李林 刘雨田 李金明 陈义平 王志亮;规避疯牛病巨大风险的技术支撑[N];中国畜牧兽医报;2006年
3 中国农业科学院 吕小文 李军国 秦玉昌;守护公共安全,技术手段须“精制配伍”[N];中国畜牧兽医报;2006年
4 关键 记者  彭溢;一项技术年创汇11万美元[N];黑龙江日报;2007年
5 闻泽;原料乳与乳制品中三聚氰胺 检测方法国家标准出台[N];中国电子报;2008年
6 史玉成;我国电梯节能有了技术支撑[N];中国质量报;2008年
7 高丽萍;花生油掺假检测方法概述[N];中国食品质量报;2009年
8 记者 张忠霞;美研究人员用新方法检测术后肺癌复发[N];人民日报;2006年
9 质量;食品三聚氰胺检测标准即将出台[N];消费日报;2008年
10 四川 钟荣;再议光耦合器的检测方法[N];电子报;2005年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978