X~2DF基于单波长反常散射法方法和参数空间筛选理论的高通量结构解析平台

【摘要】：基于单波长反常散射法方法和刘志杰研究员提出的参数空间筛选理论,利用国内外各种晶体结构解析程序(PHENIX和CCP4程序包)和现代高性能计算机集群(中国科学院生物物理所20万亿次计算机集群)的强大并行计算能力,构建快捷、易用、高效的晶体结构解析流水线(X2DF)。X2DF会对用户选择或输入的参数(空间群,分辨率,程序等)进行智能分析,然后在集群主节点上生成一定数量的独立任务,再将其提交到各子节点进行重原子搜索、相位计算、相位优化和模型构建等计算。X2DF的用户可通过互联网随时提交,查看,分析和下载计算结果。X2DF的成功实现,填补了国内晶体结构解析流水线的空白,具有相当大的实用价值。该流水线从试运行至今,已有多个无法使用常规方法解析的晶体结构被成功解析。