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酵母转录因子结合位点的理论预测

杨科利  李前忠  林昊  
【摘要】:正通过对五种实验验证的酵母转录因子结合位点序列的单碱基保守性的统计分析,以单碱基位点保守性为参数(图1),提出了预测转录因子结合位点的位置权重矩阵打分函数算法。为了尽可能的减少预测出来的假阳性(FP)结合位点序列,将已知的转录因子结合位点序列做为正集,包含结合位点可能性最小的外显子序列做为负集。用位置权重矩阵分别对正负两个数据集打分,以此来确定位置权重矩阵打分函数的最佳域值(图2)。

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