水稻全基因组DNA多态性数据库的构建(英文)

【摘要】：正 DNA polymorphism is the basis to develop molecular markers that are widely used in genetic mapping today. A genome-wide rice (Oryza sativa) DNA polymorphism database has been constructed in this work using the genomes of Nipponbare, a cultivar of japonica, and 93-11, a cultivar of indica. This database contains 1,703,176 single nucleotide polymorphisms (SNPs) and 479,406 Insertion/Deletions (InDels), approximately one SNP every 268 bp and one InDel every 953 bp in rice genome. Both SNPs and InDels in the database were experimentally validated. Of 109 randomly selected SNPs, 107 SNPs (98.2%) are accurate.

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中国期刊全文数据库

前20条

1	李宁;李庆贺;;鸡种间基因组甲基化水平的研究[J];中国家禽;2011年16期
2	王敏强;孙钦艳;刘晓玲;赵振军;赵明日;李倩;武拴虎;张志强;;鲁西黄牛和渤海黑牛MRF家族基因编码区DNA多态性分析[J];扬州大学学报(农业与生命科学版);2011年02期
3	谢荣辉;朱函坪;黄潇潇;杨章女;徐芳;姚苹苹;朱智勇;;肠道病毒EV71型浙江分离株HZ08全基因组序列分析[J];中国人兽共患病学报;2011年08期
4	王天菊;白德胜;何龙飞;李创珍;韦善清;;不同来源花生品种的ISSR分析及亲缘关系研究[J];花生学报;2011年02期
5	齐瑛琳;金宏丽;赵丽丽;王化磊;赵平森;付玉;涂长春;杨松涛;夏咸柱;;两株犬源狂犬病病毒街毒株全基因组序列测定与分析[J];中国病原生物学杂志;2011年07期
6	詹振楠;刘宛;孙梨宗;王善仙;李培军;吴海燕;;镉胁迫对拟南芥幼苗基因组DNA多态性的影响[J];生态学杂志;2011年06期
7	刘向萍;朱云芬;王桂朝;;“全基因组”时代的动物遗传育种研究[J];中国家禽;2011年11期
8	张雯雯;;云南绘出世界首个普通野生稻全基因组框架图谱[J];农药市场信息;2011年18期
9	;ISAAA信息[J];中国生物工程杂志;2011年07期
10	;马铃薯基因组研究获重大成果[J];长江蔬菜;2011年15期
11	吴建忠;;亚麻全基因组DNA的提取及分析[J];黑龙江农业科学;2011年07期
12	柳金雄;陈普成;邬丽;姜永萍;陈化兰;;鸭病毒性肠炎病毒基因组异构体的研究[J];中国预防兽医学报;2011年08期
13	;马铃薯基因组研究喜获重大成果——作为Nature封面文章发表[J];广东农业科学;2011年14期
14	黄金海;孙跃辉;庄世文;肖华志;张丽霞;;山羊关节炎-脑炎病毒陕西分离株全基因组的克隆和序列分析[J];中国兽医科学;2011年08期
15	张哲;张勤;丁向东;;畜禽基因组选择研究进展[J];科学通报;2011年26期
16	万雯婷;董扬;于洋;李丽娟;张静;李琼;王荔;胡凤益;;一种改良的水稻细胞质基因组制备方法[J];云南农业大学学报(自然科学版);2011年04期
17	;德国科学家开发出破译复杂谷物基因组的方法[J];中国科技产业;2011年07期
18	赵春华;崔法;李君;丁安明;李兴锋;高居荣;王洪刚;;冬小麦种质“矮孟牛”姊妹系遗传差异[J];作物学报;2011年08期
19	周晓罡;侯思名;陈铎文;陶南;丁玉梅;孙茂林;张绍松;;马铃薯晚疫病菌全基因组分泌蛋白的初步分析[J];遗传;2011年07期
20	杨庆东;吴兴泉;陈士华;刘晓磊;;PVY株系间的分子变异及分子鉴定方法[J];中国马铃薯;2011年03期

中国重要会议论文全文数据库

前10条

1	杨仲南;沈英嘉;江华;金健鹏;石铁流;;水稻全基因组DNA多态性数据库的构建(英文)[A];中国植物生理学会第九次全国会议论文摘要汇编[C];2004年
2	李乐;许红亮;王鹏超;胡英考;;拟南芥和水稻木聚糖酶家族全基因组鉴定、分类和表达分析[A];2010中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2010年
3	程义林;杨森;张学军;;常见复杂疾病表型基因型全基因组关联分析的问题和对策[A];中华医学会第14次全国皮肤性病学术年会论文汇编[C];2008年
4	朱坤举;张学军;杨森;;全基因组关联分析(GWAS)基因通路研究和基因—基因、基因—环境交互作用研究[A];中华医学会第16次全国皮肤性病学术年会摘要集[C];2010年
5	郑厚峰;杨森;张学军;;复杂疾病的全基因组关联分析研究新进展[A];中华医学会第14次全国皮肤性病学术年会论文汇编[C];2008年
6	温荣辉;欧融;陈保善;;菜粉蝶颗粒体病毒基因组全序列分析[A];第二届中国青年学者微生物遗传学学术研讨会论文集[C];2006年
7	何彩凤;杨森;张学军;;全基因组关联分析SNPs与冠心病的研究进展[A];中华医学会第14次全国皮肤性病学术年会论文汇编[C];2008年
8	周生;王红宁;胡慧琼;黄勇;柳萍;;禽传染性支气管炎病毒分离株SAIB_K株全基因组的克隆与序列测定[A];中国畜牧兽医学会2004学术年会暨第五届全国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会论文集（下册）[C];2004年
9	彭宜;薛峰;李彦芳;陈浩;彭大新;刘秀梵;;一株野鸭源H4N6亚型禽流感病毒A／mallard／Yanchen／2005的全基因组克隆和序列分析[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十四次学术研讨会论文集[C];2008年
10	潘伟;高玉龙;秦立廷;祁小乐;高宏雷;孙芬芬;王永强;王笑梅;;蛋鸡J亚群禽白血病病毒株HB09JY03的分离鉴定及全基因组序列分析[A];中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第八次学术研讨会论文集[C];2010年

中国博士学位论文全文数据库

前10条

1	张鸣凤;全基因组通路分析策略应用于皮肤基底细胞癌易感性的关联研究[D];南京医科大学;2012年
2	刘红;版纳病毒全基因组序列特征及其分子进化研究[D];中国疾病预防控制中心;2011年
3	张晓峰;基于籼稻全基因组剖析抗性基因的结构及其分布特点[D];浙江大学;2004年
4	赵炳然;远缘物种基因组DNA导入水稻的研究[D];湖南农业大学;2003年
5	李扬;中国汉族人特应性皮炎全基因组关联研究[D];安徽医科大学;2011年
6	关雪峰;人类原发性膝关节骨性关节炎病变软骨全基因组表达与分析[D];辽宁中医药大学;2009年
7	袁治国;丙型肝炎病毒6型和2型分子遗传学研究[D];中山大学;2012年
8	侯德才;人类原发性膝关节骨性关节炎病变滑膜全基因组表达与分析[D];辽宁中医药大学;2008年
9	陈建飞;猪流行性腹泻病毒全基因组序列分析及感染性cDNA克隆的构建[D];中国农业科学院;2012年
10	杨文平;猪H-FABP基因分子遗传多态性及其与肌内脂肪含量的关联分析[D];山西农业大学;2005年

中国硕士学位论文全文数据库

前10条

1	郝雪峰;猪繁殖与呼吸综合征病毒HN-HW株的分离鉴定及其全基因组分子特征分析[D];中国农业科学院;2009年
2	徐明;鹅源副粘病毒NA-1株全基因组序列测定及F和HN基因在真核细胞中共表达研究[D];吉林大学;2006年
3	侯昆;武汉东湖PP类噬藻体遗传多样性研究及噬藻体PP全基因组测序[D];华中师范大学;2007年
4	孙初阳;鸡传染性支气管炎病毒ck/CH/LNM/091017株全基因组序列分析及弱毒疫苗对其保护性的研究[D];东北农业大学;2010年
5	郑江涛;传染性法氏囊病病毒浙江分离株（TL2004）全基因组的克隆及生物信息学分析[D];浙江大学;2006年
6	赵炳武;猪圆环病毒2型广东毒株全基因的序列分析及分离新方法的建立[D];内蒙古农业大学;2008年
7	吴昊;猪源副黏病毒JL-1株全基因组克隆及遗传变异分析[D];吉林大学;2009年
8	刘权威;基于通路分析的中国汉族人群身高全基因组关联研究[D];湖南师范大学;2011年
9	杨祎;单细胞全基因组技术的建立和评价[D];上海交通大学;2012年
10	苏海林;全基因组选择简化模拟方法研究和贝类育种网络评估分析系统的开发[D];山东农业大学;2010年

中国重要报纸全文数据库

前10条

1	通讯员逄莎莎　记者刘传书瞿剑;我科学家主导完成白菜全基因组研究[N];科技日报;2011年
2	记者刘尊哲;中国科学家主导完成白菜全基因组研究[N];中国食品报;2011年
3	记者谭大跃　通讯员逄莎莎;白菜全基因组研究成果发表[N];深圳特区报;2011年
4	刘德培;全基因组研究　揭示人生奥秘[N];人民日报;2004年
5	记者仇逸;上海完成甲感病毒全基因组序列测定[N];新华每日电讯;2009年
6	记者谭大跃　通讯员刘旭林;世界首个鹅全基因组序列图谱绘制完成[N];深圳特区报;2011年
7	记者胡左;蒙古高原四个特色物种全基因组序列图谱绘制完成[N];科技日报;2011年
8	记者江宜航;中国成功绘制鲤鱼全基因组序列图谱[N];中国经济时报;2011年
9	记者柳珺;鲤鱼全基因组序列图谱绘制完成[N];中国渔业报;2011年
10	胡一敏、张乐;沙门氏菌全基因组研究获成果[N];人民日报海外版;2003年

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