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植物病原细菌Harpin家族的特征

张佳环  
【摘要】:以16个植物病原细菌harpin蛋白为代表,采用生物信息学方法,对harpin蛋白家族的特征进行分析。利用软件Lasergene 7.0统计分析Harpin家族的理化特性;利用在线软件CLUSTAL2.0.12进行蛋白的序列比对。结果表明,Harpin蛋白家族的等电点在3.61~6.34之间,基因在402~1113 bp之间。富含甘氨酸,绝大多数甘氨酸的含量都在13%~25%之间,不含或含有少量的半胱氨酸。富含甘氨酸序列呈现特征性分布,序列GGG-GG(或者GG-GGG)不同程度地在部分harpin中出现。来源不同种群的harpin分别具备保守序列,黄单胞菌harpin的保守序列为QGISEKQLDQLL和ILQAQNGGG;欧氏杆菌的为GQFMDQYPE和PDDDGMT;丁香假单胞菌的为LIHEKLGDNFGASA。根据分析结果,进一步将Harpin家族划分为Hpa、HrpN和HrpZ3个组群。本研究对于进一步探讨harpin蛋白的结构和功能,更好地利用harpin蛋白及其基因防治植物病害,具有十分重要的意义。

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