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大豆疫霉和苜蓿疫霉rDNA ITS序列比较研究

张正光  王源超  郑小波  
【摘要】:采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)用引物,PCR分别扩增了Phytophthora sojae的5个菌株(Pg1、Pg2、Pq3、CN1和S317)和1个P.medicaginis(菌株44390)的ITS1与ITS2,并对PCR产物进行了序列测定。根据Bioedit软件中的neighbour-joining methods分析法将上述序列和Genbank中已登录的P.sojae、P.medicaginis、P.megasperma和P.trifolii等4个形态学种10个登录菌株的ITS1与ITS2碱基序列进行聚类分析。结果是聚类组与形态学种有一定差别,4个种12个菌株分成5个聚类组:1.本研究所测的5个P.sojae菌株和Genbank中的2株P.sojae(AF266769和AF228089)成一组,各菌株的ITS1和ITS2遗传距离分别是0~0.0043和0.0093;2.菌株44390和Genbank中2株P.medicaginis(AF266799与L41379)聚为一组,3个菌株的ITS1、ITS2彼此之间的遗传距离为0.0098~0.0263;3.Genbank中的AF266800(P.trifolii)和L41380(P.megaspermal)为一组,2菌株的ITS1和ITS2距离分别是0.0049和0.0070;4.Genbank中的3个p.megasperma菌株(AF266794、L41381和L41382)成为1个聚类组,3个菌株的ITS1之间遗传距离为0.0000~0.1444,ITS2之间的遗传距离为0.0482~0.1104;5.余下的Genbank中的1株(L41385)成为一个独立的聚类组,其ITS1和ITS2与其他15个菌株的ITS1和ITS2之间的遗传距离为0.2763~0.4430。上述结果表明,分另属于同一形态学种且可聚为一组的不同个体之间的ITS碱基序列遗传相似性最高,但是也具有一定的多样性;形态学上属于不同种的个体的ITS可以聚为一组。上述结果提示L41385可能不属于P.sojae,L41380可能属于是P.trifolii,P.megasperma仍是一个复合种。同时提示ITS DNA碱基序列可以区分形态学种。

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