应用衰减全反射傅立叶变换红外光谱区分鉴定葡萄球菌临床分离株的研究

【摘要】：金黄色葡萄球菌是一种重要的细菌,可引起肺炎和菌血症等人严重感染。金黄色葡萄球菌的快速检测是食品工业生产和临床实验室预防金葡菌食物中毒和人类感染的关键。本实验旨在将衰减全反射(ATR)傅立叶变换红外光谱(FTIR)作为一种新的方法用于葡萄球菌临床分离株的快速检测鉴定。实验菌株包括4种典型性食源性致病菌的17株标准菌株和84个来源于不同医院的葡萄球菌临床分离株。经过菌株培养物收集,光谱采集和数据预处理后,通过两步法鉴定分离葡萄球菌。在分类分析之前,分别通过内部验证和外部验证来分析所建模型的分辨能力。在第一步中,选取具有菌株特性的1800～1050 cm-1的谱带,进行一阶导数运算,结合化学计量学方法进行聚类分析(HCA),并进行相关系数的统计学分析,38株金黄色葡萄球菌被正确区分鉴定,其他实验菌株被错误归类到溶血葡萄球菌中。在第二个步骤,利用软独立建模类的比喻(SIMCA),主成分回归(PCR+)和偏最小二乘回归(PLSR)建立模型进行金葡菌和溶血葡萄球菌的分离鉴定,结果表明,PLSR能够正确鉴定57株(98.3%)金黄色葡萄球菌和4株(100%)溶血葡萄球菌。另外,本实验讨论了数据预处理对鉴定能力的影响。研究表明,FT-IR有望成为一种快速检测致病菌的新方法.