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利用miRNA芯片研究胃癌发病相关的miRNA及下游信号通路分析

刘奔  王涛  郑红  李海欣  张丽娜  陈可欣  杨达  张微  
【摘要】:目的检测人胃癌与对照的癌旁组织miRNA表达谱的差异,筛选差异表达miRNA,对筛选出的高表达miRNA的下游靶信号通路进行分析,为胃癌防止中的miRNA干预策略提供可供选择的靶点miRNA。方法利用含15644个成熟miRNA基因的affymetrix人全基因组miRNA2.0芯片,检测92例胃癌和10例癌旁正常组织的差异miRNA表达基因。筛选出上调表达和下调表达的miRNA,并对胃癌不同临床分期和发生部位等临床分组中miRNA表达差异进了统计学分析。对差异miRNA作用的靶基因进行了信号通路分析。结果差异表达的miRNA基因数为608个,其中2倍以上上调的23个,下调的有5个。差异表达miRNA基因分属8个不同的miRNA簇。其中5簇miRNA为首次在胃癌中发现有表达差异。统计学分析表明其中8种miRNA表达在胃癌分期,性别,年龄,发生部位等不同临床分组均有统计学差异。生物信息学预测的靶基因分属Akt,Wnt,p53等不同信号通路。结论基因芯片筛选出的胃癌mi A差异表达基因大部分为首次发现并报道,筛选的A可以作为预测RN miRN胃癌发病指标和治疗的潜在靶点。

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