Toll样受体4基因多态性与结直肠癌易感性的相关性研究
【摘要】:目的探讨Toll样受体(Toll like receptor,TLR)4单核苷酸多态性与结直肠癌的遗传易感性的关系。方法在2005年1月至2009年12月期间,以嘉善县为研究现场,采用人群为基础的个体匹配的病例对照研究,共收集394例原发性结直肠癌存活病例和同性别,年龄相近(±5岁),并且来自同一乡镇的健康对照393例。通过开展入户调查和血样采集,收集研究对象的基本人口学特征及生活方式等调查资料和血样。采用改良盐析法抽提DNA,以SNPShot法检测TLR-4基因各多态位点基因型。利用Tagsnp方法根据Hapmap数据库中CHB(Chinese Han originin Beijing,中国汉族)数据,运有Haploview软件中的Tagger功能对TLR-4基因的多态位点进行筛选,选择的基因范围为TLR-4基因转录起始点上游2000kb至转录终止点下游2000kb。筛选原则为:Tag SNP在中国人群中最小等位基因频率大于5%,并且与区段内其它SNP的连锁不平衡系数均大于0.8。采用logistic回归分析、叉生分析等方法分析TLR-4基因多态性,生活方式以及它们交互作用与结直肠癌风险的关联。结果 Haploview软件共筛选出6个SNP,其中2个位于5'-flanking(rs10983755,rs1927914),2个位于intron2(rs11536878,rs1927907),其余2个在3'-utrexon3(rs11536889,rs7873784)。年龄、性别、文化程度、职业、婚姻状况等人口学特征在结直肠癌病例组和健康对照组分布均衡。经年龄、性别等人口学特征调整均未发现TLR-4基因上的6个Tag SNP与结直肠癌风险存在关联,rs10983755(GA/AA vs.GG:OR=1.19,95%CI=0.89-1.58),rs1927914(GA/GG vs.AA:OR=1.03,95%CI=0.77-1.39),rs1927907(CT/TT vs.CC:OR=1.20,95%CI=0.90-1.60),rs11536889(GC/CC vs.GG:OR=1.11,95%CI=0.83-1.49),rs7873784(GC/CC vs.GG:OR=1.02,95%CI=0.71-1.47),rs11536878(CA/AA vs.CC:OR=0.94,95%CI=0.67-1.31)。以不同肿瘤部位进行分层分析得到类似的结果。TLR-4单倍型分析也未发现任一单体型在病例组和对照组分布有统计学意义。此外,基因-环境交互作用结果显示,未发现TLR-4基因多态位点与生活方式因素之间存在统计学意义的交互作用(P0.05)。结论 TLR-4基因的TagSNPs多态可能与结直肠癌发病风险不存在关联;此外,未发现TLR-4基因多态位点与体质指数(BMI)、吸烟、饮酒和喝茶之间存在交互作用。
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