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染色体1p11.2区域基因多态性与中国女性乳腺癌易感性的两阶段关联研究

江玥  沈昊  马红霞  沈洪兵  
【摘要】:目的探讨全基因组关联研究报道的1p11.2区域与中国人群乳腺癌易感性的相关性。方法通过精细作图的方法筛选纳入该区域的7个多态性位点,采用两阶段病例对照的研究设计,一阶段通过TaqMan(?)OpenArray~(TM) GenotypingSystem平台对878乳腺癌病例900健康女性对照进行这7个位点的基因型检测,3个位点(rs2580520,rs4844616 and rs11249433)筛选进入TaqMan平台的第二阶段内部验证。结果位于SRGAP2基因增强子区域的rs2580520(CG)在总病例组中三种基因型(CC、CG、GG)的频率分布分别为62.7%、28.0%、9.3%,在总对照组中分别为60.8%、33.4%、5.8%。该位点的隐性模型分析与乳腺癌的发病具有统计学差异(OR=1.51,95%CI=1.16-1.97),分层分析显示在绝经早,初潮晚,初产年龄小以及ER/PR阳性的女性中rs2580520 C.G的改变同样增加了乳腺癌的发病风险。Rs4844616(CT)三种基因型(CC、CT、TT)在总病例对照中频率分布分别为45.0%、42.8%、12.2%和43.5%、44.6%、11.9%,与乳腺癌的发病无统计学关联(显性模型:OR=0.94,95%CI=0.82-1.07)而直接验证GWAS报道位点的rs11249433(TC)三种基因型TT、CT、CC在本次研究的总病例和对照中频率分布分别为92.1%、7.4%、0.5 1%和93.4%、6.4%、0.22%,与乳腺癌的发病风险没有相关性(显性模型:OR=1.20,95%CI=0.92-1.57)。结论 1p11.2上rs2580520作为中国人群特异的乳腺癌易感性位点,可能与中国女性人群的乳腺癌发病有关。

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