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用荧光差异显示法筛选肝细胞癌相关新基因

张杰  刘军建  韩云  张宁  芮静安  金城  周柔丽  
【摘要】:应用荧光-差异显示技术(F-DD)分析人肝细胞癌、配对非肝癌、胎肝、正常肝等组织之间的基因差异表达,得到差异表达 cD- NA 片段110条,选73条差异表达 cDNA 片段经测序后,与 GenBank NR 及 ESR 数据库(BLASTN 2.0.10)中的序列进行同源性比较,并选其中23条差异表达的 cDNA 片段为探针,用 RNA 狭缝杂交对其在上述组织中的表达进行验证,获得了9条差异表达片段(与 FDD 的差异符合率为39.13%)。在多数 HCC 中特异性高表达的是:未知 cDNA 片段 LC27;与智人甲状腺受体相关蛋白240基因99%同源的 LC5片段;与人热休克蛋白90β基因99%同源的 LC13片段;与人 Nip3基因 99.4%同源的 LC20片段;与智人异质性核糖核蛋白 C 基因99%同源的 LC21片段;与干扰素诱导的智人鸟嘌呤结合蛋白2基因99%同源的 LC22片段,上述片段可能会促进肝细胞癌的发生、发展。在多数 HCC 中特异性低表达的是:未知 cDNA 片段 L2、与人醛缩酶 B 基因 99.5%同源的 L7片段、与人分化相关基因1具有97%同源的 FL25片段,上述基因可能会阻抑肝细胞癌的发生、发展。本研究发现7个与 HCC 相关的已知基因片段,其中6个在肝脏和肝细胞癌中的功能及与肝细胞癌的关系尚为未知,本文报道属首例。它们在 HCC 发生发展中的作用机制,相互之间的关系以及与其它癌基因抑癌基因之间的作用,都有待于进一步的深入研究。未能找到较高同源性的 L2和 LC27基因的结构和功能的相关工作正在进行之中。

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