收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基于质谱分析的核酸修饰研究

熊军  江汉鹏  刘飞龙  袁必锋  冯钰锜  
【摘要】:DNA甲基化(5-methylcytosine,5-m C)是一种重要的表观遗传修饰。5-mC除了存在于DNA中,也广泛存在于各种RNA中。DNA/RNA中的甲基化修饰一般是酶催化形成的,其正常含量和分布是维持生命活动的基础。由于核酸代谢降解产生游离核苷酸(包括甲基化核苷酸),如果这些内源性甲基化核苷酸被利用进行核酸的合成,那么核酸上的甲基化修饰分布会有很大的随机性,从而对基因调控等多种生理产生不利影响。在本工作中我们利用课题组前期发展的化学标记-质谱分析的方法[1],建立了同时分析包括两种甲基化修饰的核苷酸在内的10种单磷酸核苷酸的高灵敏方法[2]。利用该方法,我们在人体肾组织、尿样和多种培养细胞中均检测到了甲基化修饰胞嘧啶单磷酸核苷酸(5-Me-dCMP和5-Me-CMP)。我们进一步的合成了含有重氮集团的8-DMQ (8-(diazomethyl)quinolone)试剂,该试剂可以在温和条件下和三磷酸核苷酸上的磷酸根集团进行高效反应(Figure 1A)[3]。8-DMQ试剂标记后,由于增强了离子化效率和在反相色谱柱上的保留,因此显著提高了质谱分析灵敏度。利用8-DMQ试剂标记结合质谱分析,我们成功的在体内发现包括甲基化修饰三磷酸核苷酸(5-Me-dCTP和5-Me-CTP)在内的12种新型修饰核苷酸。基于此系列研究工作,我们提出了生命体中存在除了通过酶催化的DNA/RNA修饰途径之外,还可能存在通过利用体内游离的修饰三磷酸核苷酸,在DNA复制和RNA转录过程中进行修饰的新途径(Figure 1B)。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前14条
1 ;研究揭示α微管蛋白三甲基化修饰在神经系统发育过程中的作用及机制[J];高科技与产业化;2021年07期
2 李显;丁杰;夏宇;岑祥莹;刘航;张林;蒋专;樊斐;曾家兴;李玉锦;;组蛋白甲基化修饰酶相关抑制剂在消化道肿瘤领域的研究进展[J];现代消化及介入诊疗;2020年05期
3 陈旭;刘红玲;赵凤辉;焦宗宪;王金穗;党雅梅;;Wnt5a在肿瘤进展中的作用具有争议性(英文)[J];Chinese Medical Sciences Journal;2020年04期
4 王科云;叶明亮;邹汉法;;蛋白质甲基化修饰的蛋白质组学分析方法新进展[J];色谱;2016年12期
5 郑杰;;组蛋白赖氨酸甲基化修饰与肿瘤[J];生命科学;2008年03期
6 盛伟;马端;;组蛋白赖氨酸甲基化修饰与先天性心脏病研究进展[J];遗传;2010年07期
7 梁琳;卢光琇;;组蛋白甲基化的研究进展[J];现代生物医学进展;2009年10期
8 倪健宏;杨永林;白丁平;;乙酰化、甲基化修饰与肌肉发育及分化研究进展[J];新疆农垦科技;2008年06期
9 刘惠;付蓉;;组蛋白甲基化修饰在多发性骨髓瘤发生发展中的作用研究进展[J];中国肿瘤临床;2020年13期
10 居玲莎;李仁奇;杨建军;徐建国;;DNA甲基化修饰在学习记忆中的作用[J];临床麻醉学杂志;2015年08期
11 胡济梁;杨焕杰;Jinye Mu;Tiancong Lu;Juli Peng;Xian Deng;孔照胜;鲍时来;曹晓风;左建儒;;一氧化氮通过调控蛋白质甲基化修饰介导植物胁迫反应[J];科学新闻;2018年04期
12 程智逵;过倩萍;伍会健;;组蛋白精氨酸甲基化修饰对基因转录的调控[J];生物化学与生物物理进展;2008年11期
13 肖传乐;Song Zhu;Minghui He;De Chen;Qian Zhang;Ying Chen;Guoliang Yu;Jinbao Liu;Shang-Qian Xie;Feng Luo;Zhe Liang;De-Peng Wang;伯晓晨;谷晓峰;王凯;晏光荣;;人类基因组DNA中的6mA甲基化修饰[J];科学新闻;2019年02期
14 王巍;牛燕媚;傅力;;DNA甲基化修饰与代谢相关疾病的关系及运动干预展望[J];中国运动医学杂志;2012年08期
中国重要会议论文全文数据库 前20条
1 阮科;;核磁片段筛选发现调控蛋白质动态修饰的化学探针[A];2021第二十一届全国波谱学学术年会论文摘要集[C];2020年
2 熊军;江汉鹏;刘飞龙;袁必锋;冯钰锜;;基于质谱分析的核酸修饰研究[A];中国化学会第十三届全国分析化学年会论文集(二)[C];2018年
3 任晓虎;常群群;刘威;李深盼;钟佳成;黄新凤;刘建军;;miR-199b-5p介导的SET下调可通过促进组蛋白H3K79二甲基化修饰减弱三氯乙烯诱导的肝细胞凋亡[A];中国毒理学会表观遗传毒理专业委员会第一次学术大会论文摘要集[C];2020年
4 黄烨佩;柏雪;郭振昌;张锴;张玉奎;;mRNA甲基化修饰特异性识别蛋白的分离分析新方法[A];中国化学会第22届全国色谱学术报告会及仪器展览会论文集(第二卷)[C];2019年
5 周源;;m6A甲基化的计算分析及其调控巨噬细胞极化作用初探[A];中国生理学会张锡钧基金第十五届全国青年优秀生理学学术论文综合摘要;中国生理学会第十三届全国青年生理学工作者学术会议论文摘要[C];2019年
6 周源;;m6A甲基化的计算分析及其调控巨噬细胞极化作用初探[A];2019中国生理学会学术年会暨张锡钧基金第十五届全国青年优秀生理学学术论文交流会及第十三届全国青年生理学工作者学术会议论文摘要[C];2019年
7 熊军;江汉鹏;刘飞龙;袁必锋;冯钰锜;;基于质谱分析的核酸修饰研究[A];2018年中国质谱学术大会(CMSC 2018)论文集[C];2018年
8 刘兵;刘雨豪;董爱武;;组蛋白甲基化修饰调控水稻开花时间的分子机制[A];第三届全国植物开花·衰老与采后生物学大会论文摘要集[C];2019年
9 刘建钊;;信使RNA m~6A甲基化修饰特异性的研究[A];第十届全国化学生物学学术会议报告摘要集(青年科学家论坛)[C];2017年
10 居玲莎;李仁奇;杨建军;徐建国;;DNA甲基化修饰在学习记忆中的作用[A];中国中西医结合麻醉学会[CSIA]年会暨第二届全国中西医结合麻醉学术研讨会、江苏省中西医结合学会麻醉专业委员会成立大会论文汇编[C];2015年
11 杨运桂;;RNA Methylations:Regulations and Mechanisms[A];第九届全国核糖核酸学术讨论会论文集[C];2016年
12 何志妮;李道传;李妙;张波;肖勇梅;陈雯;;FLT1高甲基化修饰可作为多环芳烃职业暴露监测的生物标志物[A];中国毒理学会第七次全国毒理学大会暨第八届湖北科技论坛论文集[C];2015年
13 金帆;;ART出生子代DNA稳定性及其甲基化修饰改变[A];2014浙江省医学会医学遗传学学术年会论文汇编[C];2014年
14 陈丰;章莉莉;万佳佳;韩倩倩;段文秀;吴疆;葛玉舒;刘丹;;针对组蛋白甲基化修饰基因编码FRET荧光探针的开发与应用[A];第十届全国化学生物学学术会议论文摘要集(墙报)[C];2017年
15 刘建钊;;生物大分子信使RNA m~6A甲基化修饰特异性的研究[A];中国化学会2017全国高分子学术论文报告会摘要集——主题B:生物大分子[C];2017年
16 周雅川;万冕;李飞飞;樊怡;周昕;杜玮;皮彩霞;崔迪新;张斌鹏;孙建勋;郑黎薇;周学东;;组蛋白甲基化修饰调控WNT5A基因在牙间充质细胞分化中的作用机制[A];2017全国口腔生物医学学术年会论文汇编[C];2017年
17 陈国强;李智立;;基于MALDI-MS的峰标签策略:一种能筛选并区分蛋白质天冬氨酸和谷氨酸体外甲基化修饰的方法[A];第十一次中国生物物理学术大会暨第九届全国会员代表大会摘要集[C];2009年
18 何志妮;李道传;陈丽萍;马璐;张爱华;段化伟;郑玉新;肖勇梅;陈雯;;不同环境暴露人群外周血淋巴细胞TRIM36基因甲基化修饰的特点和意义[A];2017环境与公共健康学术会议暨中国环境科学学会环境医学与健康分会、中国毒理学会生化与分子毒理专业委员会2017年年会论文集[C];2017年
19 李婕;张欣洁;孙清;何志妮;曾汕;张海燕;陈雯;肖勇梅;;石化厂低剂量苯暴露工人MGTM基因甲基化修饰改变[A];中国毒理学会第七次全国毒理学大会暨第八届湖北科技论坛论文集[C];2015年
20 黄维;袁必锋;冯钰锜;;液相色谱-质谱联用分析循环肿瘤细胞中DNA/RNA甲基化修饰[A];中国化学会第十一届全国生物医药色谱及相关技术学术交流会(大会特邀报告及墙报)论文摘要集[C];2016年
中国博士学位论文全文数据库 前20条
1 王晨;靶向蛋白精氨酸甲基转移酶的药物发现、优化与抗肿瘤机制研究[D];中国科学院大学(中国科学院上海药物研究所);2019年
2 刘晓丹;m_2~6A双甲基化修饰及其甲基化机理的结构和功能研究[D];中国科学技术大学;2019年
3 姜玲;组蛋白甲基化修饰对油菜开花的调控和在雄配子体发育中的分布研究[D];湖南农业大学;2018年
4 江凌慧;脓毒症患者外周血白细胞中组蛋白甲基化修饰的研究[D];复旦大学;2013年
5 陈彦韬;靶向表观遗传甲基化修饰相关蛋白的先导化合物发现与机制研究[D];中国科学院大学(中国科学院上海药物研究所);2020年
6 李静;H3K4二甲基化修饰结合蛋白的鉴定及其功能研究[D];华东师范大学;2011年
7 耿鹏宇;精氨酸甲基转移酶PRMT7的自甲基化修饰及其在乳腺癌进程中的作用和机制研究[D];东北师范大学;2017年
8 李伟哲;G9a介导的Plk1赖氨酸甲基化修饰对其酶活性及功能影响的研究[D];武汉大学;2017年
9 潘炜松;PRMT1通过对MyoD精氨酸甲基化修饰调控成肌细胞分化[D];北京协和医学院;2010年
10 王居平;TLR4乙酰化/甲基化修饰激活对炎症免疫的调节[D];浙江大学;2011年
11 党艳丽;宫颈癌DAP-kinase1基因异常甲基化修饰及其逆转的研究[D];第四军医大学;2004年
12 陈国强;20S蛋白酶体快速分离和异质性研究及蛋白质体外甲基化修饰和行为表征[D];中国协和医科大学;2010年
13 袁宏杰;NGF基因启动子区低甲基化修饰在炎性疼痛发生机制中的作用[D];苏州大学;2020年
14 严忠海;DNA甲基化修饰与内源性miRNA对珠蛋白基因表达调控的研究[D];上海交通大学;2008年
15 吴淡森;p15-piRNAs介导白血病细胞p15~(INK4b)基因DNA与组蛋白甲基化修饰机制研究[D];福建医科大学;2013年
16 刘继伟;PRMT4介导的LSD1甲基化在乳腺癌转移中的作用和机制研究[D];东北师范大学;2019年
17 刘欣;Nrf2蛋白精氨酸甲基化修饰及其在抗氧化过程中的作用和机制研究[D];东北师范大学;2016年
18 张敬各;同型半胱氨酸经DDAH/ADMA/NOS/NO通路损害血管内皮细胞的NO系统[D];四川大学;2007年
19 李语丽;基于MeRIP-seq的水稻RNA m6A甲基化修饰的研究[D];中国科学院北京基因组研究所;2015年
20 胡勇;玉米冷胁迫反应的表观调控机制[D];武汉大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前20条
1 王绯绯;转录因子YY2的赖氨酸甲基化修饰的功能和分子机制研究[D];厦门大学;2018年
2 方仲佩;基于核磁共振的两种甲基化修饰蛋白检测[D];中国科学院大学(中国科学院武汉物理与数学研究所);2019年
3 韩小云;超嗜热古菌PINA蛋白的生化性质和功能及其甲基化修饰研究[D];山东大学;2019年
4 陶雪莲;猪肌肉和脂肪组织全转录组m~6A甲基化图谱揭示转录调控功能及差异甲基化修饰模式[D];四川农业大学;2017年
5 廖光红;H3K4甲基化酶SET1A甲基化修饰YAP的机制和生物学功能的研究[D];华东师范大学;2016年
6 麻玉慧;WDR5赖氨酸甲基化修饰及其功能研究[D];东北师范大学;2016年
7 关文月;细胞特异性的DNMT1甲基化修饰对其稳定性的调控[D];华东师范大学;2012年
8 张艳玲;ZFP91与HNRNPU对METTL3的稳定性与功能调控研究[D];天津医科大学;2020年
9 韩化南;组蛋白精氨酸甲基化修饰调控拟南芥芽再生的机制研究[D];山东农业大学;2013年
10 普雪娇;甲基化修饰和位点突变分别对拟南芥SEC24蛋白功能的影响[D];深圳大学;2016年
11 任庆先;胶质瘤细胞中GDNF基因启动子1区甲基化修饰对其基因转录的影响[D];苏州大学;2012年
12 倪东京;组蛋白甲基化修饰在HBV诱导肝细胞基因表达改变中的作用机制研究[D];第三军医大学;2014年
13 赵圆圆;YAP精氨酸甲基化修饰调控Hippo通路及肿瘤细胞增殖的初步研究[D];安徽医科大学;2020年
14 赵晶;p16精氨酸甲基化修饰及其功能的初步研究[D];东北师范大学;2011年
15 黄雯静;m~6A甲基化修饰调控牛病毒性腹泻病毒NS5A的表达[D];黑龙江八一农垦大学;2021年
16 李广庆;基于序列的RNA甲基化修饰位点预测研究[D];南京理工大学;2017年
17 谷雪妹;YAP甲基化修饰调节脂肪酸合成与氧化促进肥胖发生的机制研究[D];安徽医科大学;2021年
18 黄焱;基于生物信息学方法分析RNA甲基化修饰的研究[D];河北工业大学;2019年
19 倪泽桂;JNK信号调控膀胱癌细胞m~6A甲基化修饰的机制研究[D];安徽医科大学;2021年
20 赵家荣;METTL21C介导IGF2BP1赖氨酸甲基化修饰调控鸡成肌细胞增殖机制研究[D];陕西理工大学;2020年
中国重要报纸全文数据库 前7条
1 彭科蜂;组蛋白甲基化修饰研究再获突破[N];中国科学报;2015年
2 记者 丁佳;中科院植物所 解析果实成熟调控新机制[N];中国科学报;2019年
3 记者 孙国根;触发白血病关键蛋白工作机制被揭示[N];健康报;2014年
4 孙国根;白血病发生关键蛋白工作新机制被发现[N];中国医药报;2014年
5 本报特约撰稿 王丹红;20年磨一剑 打开DNA研究新天地[N];四川科技报;2007年
6 生命学院;杨茂君研究组在《基因与发育》上发文[N];新清华;2014年
7 记者 李鹏;孪生凶手,杀死DNA检测?[N];北京科技报;2012年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978