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DNA硫修饰的结构与功能

赵一雷  
【摘要】:DNA硫修饰是一种新型表观化学修饰,细菌基因组分析表明有5-8个基因形成一个硫修饰功能基因簇,把硫原子从半胱氨酸转移到DNA上替换非桥键氧。细菌生物学研究发现其有可能与细菌防御外来基因入侵有关,也有可能与抵抗氧化损失有关。我们通过结构生物信息学研究了硫修饰R立体手性对DNA的高级结构的影响、与周边碱基对发生物理化学互作。首先我们利用量子化学计算比较了修饰之前后的局部结构变化,并构建能量打分函数挖掘正常和硫修饰DNA的磷酸骨架二面角分布差异,进一步通过分子动力学模拟研究不同碱基序列的DNA磷酸骨架柔性变化,从而揭示碱基对、碱基阶梯的特征结构参数细微差异。理论计算发现了R型DNA硫修饰能够干扰DNA的B型双螺旋结构的稳定性,与S-DNA的熔点实验结果相吻合。硫修饰提高了DNA骨架的刚性,与正常DNA相比,骨架与碱基的相互作用变强而提高了碱基序列特异性,特别是与含鸟嘌呤碱基对阶梯互作,表明了DNA硫修饰结构与其分子识别和抗氧化性有直接关系。

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14 李树青;;DNA[J];商场现代化;1984年10期
15 徐有成,钱力,陶宗晋;A HYPOTHESIS OF DNA STRUCTURE——INSPIRATION FROM THE TOPOLOGICAL TRANS-FORMATION OF SUPERCOILED DNA[J];Science in China,Ser.B;1982年08期
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19 ;Regulation of Cleavage Activity of Ser-His Dipeptide on DNA by Phosphorylation[J];Chinese Chemical Letters;1997年07期
20 ;A Special Property of DNA--as an Electrocatalyst[J];Chinese Chemical Letters;1998年03期
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2 ;Hormonal Regulation and Tumorigenic Role of DNA Methyltransferase[A];2011中国妇产科学术会议暨浙江省计划生育与生殖医学学术年会暨生殖健康讲习班论文汇编[C];2011年
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