收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

系统收集PDB数据库中的亲合性数据:PDBbind数据库的最新进展

刘志海  李嫣  韩莉  刘杰  赵志雄  聂伟  刘宇晨  王任小  Jie Li  
【摘要】:生物大分子与有机小分子配体之间的相互识别在各种生命活动过程中扮演很重要的角色。生物大分子复合物的三维结构和亲合性信息是描述这些生命过程的底层机理所不可或缺的信息。PDBbind数据库的创建目的是完整收录Protein Data Bank(PDB)数据库中通过实验测定的亲合性数据。由此为生物大分子复合物的结构信息和能量信息提供相互联系,而这些信息在计算模拟研究中非常重要。自2004年首次公开发布以来,PDBbind数据库保持每年更新一次。即将发布的最新2016版中将大约包含16000个复合物的亲合性和三维结构信息。我们的研究表明,PDBbind中的数据信息与其他的同类大型数据库,比如ChEMBL具有很大的互补性,具有独特的研究价值。PDBbind中所有的数据都可以通过如下网站免费获取和使用:http://www.pdbbind-cn.org http://www.pdbbind.org.cn

知网文化
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978