对于药物不良反应预测模型的系统研究

【摘要】：早期准确预测药物不良反应(ADRs)对于药物研发和临床安全具有重要的意义。近年来计算机辅助预测药物不良反应得到越来越多的关注,许多计算模型也相继提出[1,2,3]。然而,由于缺少对于这些计算模型的系统分析和比较,因此在设计更优算法和特征上存在一些盲目性。因此目前非常需要去总结和分析目前计算模型,从中获得一些普适的结论,从而为构建更高效的药物不良反应预测提供有益的指导。这里我们系统的考察了不同的计算模型。结果表明,拓扑特征和固有特征具有一定程度的互补性,其中拓扑特征Jaccard系数对于药物不良反应的预测具有重要和普遍的影响。通过比较各个算法结构发现,这些算法都可以转换成线性模型,由此我们提出了一个广义加权的算法模型并且获得了比其他算法更好的整体性能。