收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

A New Strategy of Exploring Metabolomics Data Using Monte Carlo Tree

曹东升  梁逸曾  李洪东  
【摘要】:正Large amounts of data from high-throughput metabolomics experiments become commonly more and more complex,which brings a number of challenges to existing statistical modeling.Thus there is a need to develop statistically efficient approach for mining the underlying metabolite information contained by metabolomics data under investigation.In the work,we provide a new strategy based on Monte-Carlo cross validation coupled with the classification tree algorithm, which was termed as the MCTree approach.The MCTree approach inherently provides a feasible way to uncover the predictive structure of metabolomics data by establishment of many cross-predictive models.With the help of the sample proximity matrix such obtained,it seems to be able to give some interesting insights into metabolomics data.Simultaneously,informative metabolites or potential biomarkers can be successfully discovered by means of variable importance ranking in the MCTree approach.Two real metabolomics datasets are finally used to demonstrate the performance of the proposed approach.

知网文化
【相似文献】
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 ;Quark Confinement and String Breaking from Lattice QCD[A];Physics of Glueballs and New Hadron States--Proceedings of CCAST (World Laboratory) Workshop[C];1999年
2 ;Monte Carlo Simulations of Reversible Melting on the Fold-end Surfaces of Polymer Lamellar Crystals[A];“国际化学年在中国”——中国化学会第三届全国热分析动力学与热动力学学术会议暨江苏省第三届热分析技术研讨会论文集[C];2011年
3 ;Monte Carlo Methods in Scientific Computing[A];2006“与统计有关的凝聚态物理中一些数值计算问题”研讨会论文集[C];2006年
4 曹东升;梁逸曾;李洪东;;A New Strategy of Exploring Metabolomics Data Using Monte Carlo Tree[A];第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2011年
5 ;Quantum Monte Carlo Methods for Strongly Correlated Electron Systems[A];Physics in Strongly Correlated Systems--Proceedings of CCAST (World Laboratory) Workshop[C];2001年
6 R.Ricardo;A.Magallanes;F.Candilio;;Monte Carlo Analysis of Nodes Deployment for Large-Scale Wireless Sensor Network Using range-free Location Methods[A];Proceedings 2010 IEEE 2nd Symposium on Web Society[C];2010年
7 惠群;;Reverse Monte Carlo modelling of cation distributions in crystal structures[A];2007“与统计有关的凝聚态物理中一些数值计算问题”研讨会论文集[C];2007年
8 吴和成;;某系统寿命计算的Monte Carlo实现[A];中国现场统计研究会第九届学术年会论文集[C];1999年
9 曾志;李君利;许振华;邱睿;;质子剂量的Monte Carlo计算方法[A];中国生物医学工程学会第六次会员代表大会暨学术会议论文摘要汇编[C];2004年
10 王吉山;苏桐龄;;活体中子活化分析辐照装置的Monte Carlo模拟计算[A];第十二届全国核物理大会暨第七届会员代表大会论文摘要集[C];2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 凌君;新型稀土催化剂催化开环聚合及Monte Carlo模拟研究[D];浙江大学;2002年
2 傅游;稀薄气体Monte Carlo数值仿真并行化技术研究与实现[D];西北工业大学;2002年
3 尚也淳;SiC材料和器件特性及其辐照效应的研究[D];西安电子科技大学;2001年
4 周灿栋;高氮35CrMoV钢的制备和研究[D];上海大学;2001年
5 王秀丽;Gibbs系综Monte Carlo方法研究流体相平衡[D];天津大学;2004年
6 王维斌;超细晶粒钢直流电阻闪光对焊过程数值模拟及接头组织性能预测[D];北京工业大学;2003年
7 罗正鸿;D_4/APAEDMS本体开环共聚及其数学模拟[D];浙江大学;2003年
8 杨杰;非线性结构随机分析数值模拟的方法研究[D];西南交通大学;2004年
9 傅玉川;基于虚源概念的空腔电离室理论研究[D];四川大学;2002年
10 谢更新;水环境中的不确定性理论与方法研究——以三峡水库为例[D];湖南大学;2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王卉;双亲分子膜的模拟研究与热力学标度Monte Carlo方法的开发[D];北京化工大学;2011年
2 张阔;Monte Carlo方法模拟一元、二元流体的临界性质[D];河南工业大学;2012年
3 樊艳;ZnS材料电子输运特性的Monte Carlo模拟[D];河北大学;2009年
4 周慧燕;自适应的Monte Carlo方法对具有共同光滑函数类的信息基复杂性[D];西华大学;2012年
5 江锦;点源目标被动式跟踪算法研究[D];西北工业大学;2004年
6 向远涛;有效中心对称模型势的统计热力学与计算机模拟研究[D];中南大学;2011年
7 周爱芳;生物陶瓷体内降解过程模拟与可视化研究[D];武汉理工大学;2003年
8 汪凌云;高分子链构象统计的Monte Carlo 研究[D];安徽师范大学;2003年
9 王磊;陆军船艇总纵强度可靠性研究[D];天津大学;2003年
10 刘敏轩;W/O型微乳液制备纳米颗粒的Monte Carlo法模拟[D];天津大学;2003年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 ;Intel扩充安腾2产品线, 06年批量交付Montecito[N];计算机世界;2004年
2 本报记者 何芳;鲁兹能为通用带来多大变化[N];中国汽车报;2001年
3 ;布尔率先将Monterey/64移植到8路Intel Itanium服务器[N];网络世界;2000年
4 邵澄江;手机知识上网学[N];电脑报;2002年
5 方笑菊;通用新车再玩美国车市“数字”游戏[N];中国汽车报;2004年
6 乔纳森·惠特利;梅洛战无不胜的营销法宝[N];国际金融报;2005年
7 ;整机动态[N];中国计算机报;2000年
8 ;手机上的MSN[N];中国电脑教育报;2005年
9 任毓骏;“SARS”比“非典”更准确[N];保健时报;2003年
10 闫书强;IDF2004:双内核CPU与无线技术唱主角[N];中国电脑教育报;2004年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978