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利用开源软件TPP和NIST肽质谱库搭建LC-MS/MS肽质谱数据鉴定平台

张志敏  李洪东  梁逸曾  
【摘要】:蛋白组学的实质上是在分子水平上对蛋白质进行大规模的平行分离和分析,往往要同时处理成千上万种蛋白质。因此,发展高通量、高灵敏度、高准确性的研究技术平台是现在乃至相当一段时间内蛋白质组学研究中的主要任务。串联质谱(MS/MS)就是应此需求而产生,用于鉴别复杂混合物中蛋白质成分的一种有效的技术手段。样品中的蛋白质首先经酶解(通常为胰蛋白酶)生成较小的肽,注入反相色谱进行分离,继利用 ESI 或 MALDI 等技术手段将肽离子化,最后有选择性的选择一部分离子化的肽,利用 CID 方法产生特征的肽 MS/MS 质谱。进行蛋白序列库或肽质谱库搜索和比对来鉴别不同肽链,以获得样本中蛋白质的信息。所以,构建高质量、高效率的 LC-MS/MS 肽质谱数据鉴定平台是蛋白组学的一个十分重要的研究课题。

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1 张志敏;李洪东;梁逸曾;;利用开源软件TPP和NIST肽质谱库搭建LC-MS/MS肽质谱数据鉴定平台[A];第九届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2007年
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