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应用ABEEM/MM模型研究氮甲基乙酰胺水分子团簇的性质

钱萍  杨忠志  
【摘要】:正氮甲基乙酰胺(NMA)作为蛋白质肽链结构的一个最简单的模型分子,已被广泛地应用于实验和理论方面的研究。尤其在水溶液中,它与水分子之间的相互作用在肽的溶剂化过程中起到至关重要的作用。基于原子-键电负性均衡方法融合进分子力场(ABEEM/MM), 我们提出了NMA与水的势能模型,并且应用该模型研究了氮甲基乙酰胺水分子团簇的性质。 NMA与水的势能模型有以下两个优点:(1)ABEEM/MM模型能够很好的处理所有原子、

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