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条斑紫菜锰超氧化物歧化酶基因克隆与序列分析

王荣  刘涛  周晓君  庄筠昀  茅云翔  
【摘要】:为研究紫菜抗逆抗病的分子机制,以本实验室建立的条斑紫菜表达序列标签(EST)和全长 cDNA 富集文库,结合 PCR 技术,克隆了条斑紫菜编码锰超氧化物歧化酶(Mn-SOD)的 cDNA 及基因组 DNA 全长序列,并进行了序列特性相关分析。研究结果表明:该基因 cDNA 序列全长为958个核苷酸,包含一个完整 Mn-SOD 基因的 ORF,编码224个氨基酸和终止密码子;该基因在基因组中序列长度为1416bp,包含4个外显子和3个内含子,这既不同于高等植物的6个外显子和5个内含子,也不同于人的5个外显子和4个内含子;该基因编码区密码子的平均 GC 含量为60.9%,第三位密码子的 GC 含量高达84.9%;序列中包含4个与 Mn~(2+)的结合位点及一个保守的金属结合结构域,预测分子量为24469.09Da,等电点为5.99;条斑紫菜 Mn-SOD 与人的相关蛋白具有类似的空间结构,都有6个跨膜α螺旋结构域;由 cDNA 序列推导的氨基酸序列与莱茵衣藻相似性为57.7%,系统发生分析表明条斑紫菜 Mn-SOD 与绿藻莱茵衣藻和硅藻海链藻的亲缘关系较近。这是该基因在红藻门中的首次报道。

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2 周百成;武宝玕;曽呈奎;肖光琰;;条斑紫菜的色素系统和光合作用的差异性[J];科学通报;1966年09期
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10 金治平;赵德修;乔传令;翟文全;陈亚琼;付春祥;;水母雪莲Myb转录调控因子SmP基因的克隆及序列分析[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年
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1 杨惠;条斑紫菜功能基因组及重复序列特征研究[D];中国海洋大学;2011年
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