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鸭病毒性肝炎病毒NA株全基因序列测定及分析

王劭  陈少莺  朱小丽  程晓霞  陈仕龙  林锋强  李兆龙  
【摘要】:本研究应用RT-PCR方法分段扩增DHV-NA株cDNA,并进行基因组全序列测定及同源性等分析。结果显示DHV-NA株基因组全长7692bp(不包括PolyA),5'和3'非编码区长度分别为626和316bp,有一个单一开放阅读框架(ORF,627~7376nt),编码2249个氨基酸;与Ⅰ型DHV(DHV-Ⅰ)参考株比较,其核苷酸和氨基酸同源性分别为94.3%~96.9%和97.8%~98.8%;与新型DHV(N-DHV)90D株比较,其核苷酸和氨基酸同源性分别为72.6%和82.3%。表明NA株与DHV-Ⅰ参考株遗传进化关系较为密切,而与N-DHV遗传关系较远。

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