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基于生物信息学的功能蛋白基因序列分类研究

陈婷婷  郭婷婷  李林  安冬  
【摘要】:生物信息学最首要的任务是从大量的生物信息数据中提取有价值的知识,在生物信息学中用未知功能的序列与已知功能的序列进行比较来预测未知功能序列的功能,是发现知识的一种常用的手段。本文主要是采用BLAST算法对植物病毒编码的运动蛋白基因序列和衣壳蛋白基因序列进行序列比对,在比对的结果距离矩阵上,用主成分分析方法提取5维特征向量,最后用支持向量机建立两类蛋白基因序列的分类模型并验证模型效果,验证样本的正确识别率和正确拒识率都能达到80%或更高。

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