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大口黑鲈胰岛素样生长因子Ⅱ基因SNPs的检测及与生长性状的关联分析

李小慧  白俊杰  胡隐昌  叶星  李胜杰  
【摘要】:胰岛素样生长因子Ⅱ(Insulin-like growth factorⅡ,IGF-Ⅱ)对脊椎动物的生长和发育起重要作用,是家畜生长性状的重要候选基因。与哺乳动物不同,从早期的胚胎发育直至成年阶段,硬骨鱼类IGF-Ⅱ的基因表达都保持较高的水平,因而IGF-Ⅱ对硬骨鱼的生长发育可能发挥更重要的调节作用。在本研究中,我们获得了大口黑鲈IGF-Ⅱ基因的全长序列和基因的组织结构,检测了IGF-Ⅱ基因的SNPs位点,构建几个SNPs的单倍型。进一步分析IGF-Ⅱ基因的SNPs位点及其构成的单倍型与大口黑鲈生长性状的相关性。结果显示,大口黑鲈IGF-Ⅱ基因由4个外显子和3个内含子构成,在IGF-Ⅱ基因上共发现了4个SNPs,其中一个SNP位于外显子3上,其它SNPs位于内含子中。基于4个SNPs,构建得到7种单倍型,获得13种二倍型。关联分析结果显示,4个SNPs与大口黑鲈体重和体尺等生长性状没有显著相关性,然而4个SNPs构成的单倍型显著影响大口黑鲈的体重,二倍性D3和D4的体重显著高于其它单倍型。这表明IGF-Ⅱ基因的SNPs相互作用可能影响大口黑鲈的生长性状表型。

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