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新陆早棉花品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析

聂新辉  尤春源  黄聪  郭欢乐  王夏青  赵文霞  林忠旭  
【摘要】:以新疆截止2012年审定的51个新陆早常规棉花品种(杂交棉品种除外)为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析。实验从5000对SSR引物中筛选出多态性高、稳定性好、且明确定位在棉花26条染色体上(每条染色体上选择2~3对)的核心引物75对。SSR扩增检测到多态性基因型位点数共计226个,每个标记检测到的基因型位点数在2~12之间。平均为3.01个;引物多态信息量(PIC)值介于0.0799~0.8752之间,平均值为0.6624。结果显示:在51份新陆早棉品种中,21份品种可利用特征引物从51个品种一次性区分开,其余30份品种鉴别需要采用组合引物。至少选用40对引物就可以完全区分开新陆早1~54号品种。利用40对SSR标记构建了新陆早1号至54号品种的指纹图谱。同时利用NTSYS-pcV2.10软件聚类分析表明:51个新陆早棉花品种遗传相似系数变化范围为0.4269~0.9873,平均值为0.7071,表明新陆早棉花品种之间遗传多样性较狭窄;遗传相似系数矩阵和聚类分析将51个新陆早品种分为4大类型,与原品种选育系谱高度吻合。

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