收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

白王鸽骨骼肌生长发育ceRNA调控网络构建及关键ceRNA鉴定

张闪闪  陈兰  张涛  
【摘要】:在我国,鸽肉一直作为珍贵的滋补食品深入人心,素有"一鸽胜九鸡"的美誉。目前,我国已经成为国际上肉鸽生产和消费大国。目前,我国肉鸽的消费以30日龄乳鸽为主,而乳鸽30日龄体重与骨骼肌的生长发育密切相关。不同于其它禽类,鸽虽属于晚成雏,在出生后不具有自我觅食能力,但是其出生后早期生长速度快,强度大,7-10日龄既可达到生长拐点,4周龄体重可达初生重的29-36倍,因此,解析肉鸽早期高生长速度的遗传机理,对于肉鸽生长性状的改良具有十分重要的意义。近年来,非编码RNA功能受到广泛关注,大量研究表明,circRNA和lncRNA等非编码RNA作为ceRNA在畜禽骨骼肌生长发育过程中发挥重要的调控作用,但是鸽骨骼肌生长发育相关的ceRNA调控机制尚未见报道。本研究利用高通量测序技术分析了鸽骨骼肌生长发育过程中circRNA、lncRNA、mi RNA和m RNA的表达趋势,筛选了鸽骨骼肌生长发发育过程中的差异表达circRNAs、lncRNAs、mi RNAs和m RNAs,并基于靶基因预测、基因表达关系和超几何分布检验构建鸽骨骼肌生长发育相关的ceRNA调控网络。结果共鉴定到4918条lncRNAs、10346条circRNAs和2363条mi RNAs,基因表达相关性分析显示,鸽骨骼肌8胚龄和13胚龄基因表达模式高度相关,而胚胎期和生长早期基因表达模式相关性较低,表明鸽骨骼肌胚胎期和生长早期生长发育的调控机制存在较大差异。表达趋势分析结果显示,33个显著趋势中,24个为下调,表明鸽骨骼肌在生长期的基因调控活动要弱于胚胎期,胚胎期非编码RNA的调控活动更为活跃。最终,基于ceRNA假说,本研究成功构建了鸽骨骼肌相关的ceRNA调控网络,并从中筛选出5个重要的circRNA-miRNA-mRNA关系对和15个重要的lncRNA-miRNA-mRNA关系对。我们推测,非编码RNA Novel_circ_009286、Novel_circ_006689、Novel_circ_009211、Novel_circ_006689、Novel_circ_000030、TCONS_00020696、TCONS_00056927、TCONS_00062175、TCONS_00025283、TCONS_00071495、TCONS_00041483、TCONS_00026594、TCONS_00041482、TCONS_00074320可能分别通过竞争性吸附cli-miR-499-5p、cli-miR-1b-3p、cli-miR-1a-3p,cli-miR-206-5p和cli-miR-133a-3p,调控MAPK6、BDNF、RARB、FSTL1和FZD7基因表达,进而参与调控鸽骨骼肌生长发育调控,但是上述基因调控鸽骨骼肌生长发育的具体分子机制尚待进一步研究。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 张乙凡;潘耀振;陈玲;喻超;孙诚谊;;肝癌ceRNA调控网络的分析研究[J];中国研究型医院;2018年03期
2 曹泽标;刘闯;王保华;李赛美;;从“亢害承制”理论探讨糖脂毒性下β细胞损伤及其ceRNA调控网络[J];中医杂志;2020年05期
3 叶蓓玮;韩辉;曹鹏博;秦庚;李海北;周钢桥;;长链非编码RNA LINC00657作为ceRNA促进肝癌细胞的增殖和迁移[J];军事医学;2018年10期
4 詹妮;谢耀坚;吴志华;刘果;尚秀华;;ceRNA对植物纤维素形成的调控研究进展[J];桉树科技;2019年01期
5 郑莉梅;薛松;;急性心肌梗死相关的ceRNA调控网络构建[J];徐州医科大学学报;2019年06期
6 王子源;傅昭粤;张锦鹏;张哲;郑卓驹;姜东伯;杨琨;;ceRNA在肿瘤中的作用与机制[J];转化医学电子杂志;2017年10期
7 李镇宜;李文鹏;周志威;黄毓涛;陈钦标;邓跃飞;雷炳禧;;基于lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络构建筛选老年胶质母细胞瘤相关lncRNAs[J];岭南急诊医学杂志;2019年02期
8 张莉;刘诗意;王艳清;杨潇;程艳香;;lncRNA作为ceRNA在卵巢癌中的研究进展[J];国际生殖健康/计划生育杂志;2019年03期
9 蒋琼;;LncRNA RSU1P2在宫颈癌肿瘤细胞中作为ceRNA拮抗let-7a促进肿瘤发生的影响研究[J];河北医药;2017年20期
10 李艳;沈飞阳;马礼丹;张艳青;;竞争性内源RNA与肿瘤发生的研究进展[J];基础医学与临床;2015年11期
中国重要会议论文全文数据库 前2条
1 张闪闪;陈兰;张涛;;白王鸽骨骼肌生长发育ceRNA调控网络构建及关键ceRNA鉴定[A];江苏省遗传学会2019年学术研讨会论文集[C];2019年
2 郭胜男;徐泽龙;刘格睿;;基于染色体不稳定性和失调ceRNA构建肺腺癌预后标志物识别模型[A];2019年(第六届)全国大学生统计建模大赛优秀论文集[C];2019年
中国博士学位论文全文数据库 前8条
1 李锡丁;在胃癌中上调的CCAT1作为ceRNA促进胃癌恶性进程研究[D];苏州大学;2018年
2 王翰博;肌层浸润性膀胱癌中长链非编码RNA和miRNA差异表达谱及相关ceRNA调控网络的分析研究[D];山东大学;2017年
3 张杰;Sp1作为Klf4的ceRNA调控成牙本质细胞分化[D];武汉大学;2016年
4 李俊;SNAI2作为ceRNA调控MARCKS表达促进卵巢癌侵袭转移的分子机制研究[D];复旦大学;2014年
5 姜丛;PHLPP2以ceRNA的形式调控FBW7表达的机制和功能研究[D];华东师范大学;2014年
6 蒋俊锋;长链非编码RNA BACE1-AS促进Aβ聚集及其调节BACE1和SERF1a的ceRNA机制研究[D];第二军医大学;2015年
7 万晓朋;白细胞介素27抑制肥大细胞介导的免疫反应及其机制研究[D];浙江大学;2015年
8 张素洁;长非编码RNA LncTSG1抑制肝癌转移的功能及机制研究[D];中国人民解放军医学院;2016年
中国硕士学位论文全文数据库 前5条
1 张一鸣;人肝癌中p53调控的ceRNA网络分析与转录因子介导的增强子-RNA数据库构建[D];西南交通大学;2018年
2 刘洋;人表皮干细胞lncRNA与mRNA差异表达相关性及其作为ceRNA的作用分析[D];南昌大学;2017年
3 陈文康;LncRNA HOTAIR作为miR-130b的ceRNA调控PTEN/AKT信号通路影响髓核细胞增殖[D];南华大学;2017年
4 郭跃楠;LncRNA PTENP1在胃癌中作为ceRNA调控PTEN表达的作用及机制研究[D];天津医科大学;2017年
5 盛春海;热休克蛋白gp96 3’UTR作为ceRNA通过miR-642a调控DOHH表达的研究[D];安徽大学;2016年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978