水稻重组自交系分子遗传图谱构建及分蘖角的QTL检测

【摘要】：水稻是世界上重要的粮食作物之一。水稻作为禾本科的模式作物,对其进行分子水平的研究具有极其重要的意义。国内外众多学者利用SSR、RFLP等标记对多种作图群体构建了大量的水稻分子遗传图谱。这些图谱的构建为水稻重要性状基因定位、基因克隆及分子育种等打下了坚实的基础,并得到了广泛的应用。本研究利用株型差异显著的特大粒粳稻品系TD70和籼稻小粒品种Kasalath为亲本配制组合,以单粒传方法构建含240个株系的重组自交系(RIL)群体。选用均匀分布于整个水稻基因组的838对SSR引物进行亲本多态性筛选,共检测到302对具有多态性的引物,频率为36.04%。选择带型清晰且在基因组中分布较均匀的标记构建了一个含141个SSR标记座位的水稻分子连锁图谱,总图距约1832.47cM,标记间平均图距为13cM,图距范围为0.43cM～36.11cM,符合QTL作图的基本要求。本实验群体中父母本基因型频率分别为53%和47%,群体结构平衡性好。SSR标记中存在显著(P0.05)偏分离的标记占总标记的51.8%,大多偏向于父本。除第1、第8染色体个别标记位置不同外,其它染色体上标记顺序和位置与已公布的日本晴序列基本一致。分蘖角度是水稻重要的株型性状,也是构成水稻理想株型和高产的重要农艺性状。以该群体为材料,对分蘖角度进行了QTL检测,共检测到控制分蘖角度的3个QTL位点,分别是qTA8、qTA9和qTA11,贡献率分别为4.10%、26.08%和4.35%。其中qTA9包含控制水稻分蘖角度基因TAC1,qTA9的加性等位基因来源于Kasalath,能够增大植株的分蘖角度。qTA8和qTA11是否为新的QTL位点,有待进一步验证。该图谱的构建为研究籼粳杂交后代各种性状的遗传规律及QTL定位打下了基础。