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MLVA、spoligotyping技术应用于结核分枝杆菌基因分型的初步研究

刘梅  
【摘要】:目的初步评价多位点可变数目串联重复序列(MLVA)及间隔寡核苷酸分型方法(spoligotyping)在结核分枝杆菌基因分型效果中的应用。材料与方法随机挑选130株结核分枝杆菌临床分离株,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术,对结核分枝杆菌19个VNTR位点进行检测,选取不同位点的组合,并通过BioNumerics 5.0软件进行DNA指纹图谱多态性分析,比较与间隔寡核苷酸分型方法(spoligotyping)单独或联合应用的分型能力。结果 15、11、10、9个VNTR位点的MLVA,以及spolityping对应的分型能力—汉高指数(HGI)为0.9918、0.9988、0.9988、0.9988、0.4433。11-1ocus、10-locus、9-locus MLVA不仅分辨力指数相同,聚类结果也完全相同。当各位点组合MLVA分别与spoligotyping联合应运用时,除15-locus MLVA+spoligotyping分辨力为0.9858外,其余位点组合MLVA+spoligotyping,分辨力指数HGI均为0.9988,与它们单独应用时相同。结论 9-locus MLVA可作为中国监控结核分枝杆菌的一线方法。MIRU23、MIRU27不适合应用于结核分枝杆菌基因分型。

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