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Interplay between the bacterial protein deacetylase CobB and the second messenger c-di-GMP

Zhaowei Xu  Hainan Zhang  Xingrun Zhang  Hewei Jiang  Chengxi Liu  Fanlin Wu  Lili Qian  Bingbing Hao  Daniel M Czajkowsky  Shujuan Guo  Zhijing Xu  Lijun Bi  Shihua Wang  Haitao Li  Minjia Tan  Wei Yan  Lei Feng  Jingli Hou  Sheng-ce Tao  
【摘要】:As a ubiquitous bacterial secondary messenger, c-di-GMP plays key regulatory roles in processes such as bacterial motility and transcription regulation. CobB is the Sir2 family protein deacetylase that controls energy metabolism, chemotaxis, and DNA supercoiling in many bacteria. Using an Escherichia coli proteome microarray, we found that c-di-GMP strongly binds to CobB. Further, protein deacetylation assays showed that c-di-GMP inhibits the activity of CobB and thereby modulates the biogenesis of acetyl-CoA. Interestingly, we also found that one of the key enzymes directly involved in c-di-GMP production, DgcZ, is a substrate of CobB. Deacetylation of DgcZ by CobB enhances its activity and thus the production of cdi-GMP. Our work establishes a novel negative feedback loop linking c-di-GMP biogenesis and CobB-mediated protein deacetylation.

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