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敏捷气热菌(Aeropyrum pernix)基因组密码子使用偏好分析

张光亚  刘桂兰  方柏山  
【摘要】:正 对好氧超嗜热古菌-敏捷气热菌(A.pernix)中2713 CDS’s(编码序列)共计648524个密码子的使用偏好进行了分析,结果表明A.pernix中密码子的使用存在明显的偏好性,这些优势密码子的第三位碱基几乎均以G或C结尾,而以A或者U结尾的密码子使用频率很低,使用胞嘧啶(C)的次数是使用鸟嘌呤(G)的2.6倍。同时与大肠杆菌(E.coli)、酵母(S cerevisiae)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、果蝇(Drosophila melano-gaster)、强烈炽热球菌(Pyrococcus furiosus DSM 3638)、蚜虫初生内共生菌(Buchnera sp.APS)、棒状节杆菌

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