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近交系基因敲除小鼠微卫星不稳定性分析

左宝芬  杜小燕  陈振文  
【摘要】:目的前期研究从文献中选取了198个与基因突变和疾病相关的小鼠微卫星不稳定性位点,经对转基因和基因突变小鼠研究,发现有41个位点具有不稳定性。为了进一步确认这些位点与基因改变的相关性,本实验应用这41个微卫星位点对29种C57BL/6J基因敲除小鼠进行了检测,并将野生型C57BL/6J和129品系小鼠(ES供体)作为对照。实验通过PCR扩增,STR扫描和直接测序的方法检测微卫星的不稳定性;结果显示在41个微卫星位点中有10个位点在11种基因敲除小鼠中呈现不稳定性(24.4%,10/41);核心序列为三核苷酸的D3Mit22在9号基因敲除小鼠中显示不稳定性;其余40个位点的核心序列均为二核苷酸,有9个位点呈现不稳定性(22.5%,9/40);另一方面,29种基因敲除小鼠有11种出现了不稳定性(37.9%,11/29);(TG)_n为核心序列的二核苷酸表现不稳定性的比率最大(50%,2/4),依次为(GT)_n(27.27%,3/11)和(AG)_n25%(1/4),重复序列(CA)_n以及(CT)_n分别为23.08%(3/13)和20%(1/5)。根据克隆测序的结果,6种基因敲除小鼠呈现核心序列片段的插入,1种基因敲除小鼠则为缺失。有2个位点(D13Mit3和D14Mit102)在两种基因敲除小鼠中出现不稳定性,9号基因敲除小鼠在2个位点(D3Mit22和D13Mit3)呈现不稳定性。结果显示基因敲除小鼠出现了微卫星不稳定性。

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