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不同葡萄糖浓度对变链菌sRNA水平及表型的影响

刘姗姗  周燕  陶冶  庄沛林  曹依娜  支清惠  林焕彩  
【摘要】:目的比较1%和5%的葡萄糖条件对变异链球菌(变链菌)sRNA水平及相应表型的影响。方法将变链菌于1%和5%的葡萄糖条件下培养,分离纯化总RNA,构建含18-50个核苷酸产物的文库并进行测序,选取50个差异表达的sRNAs进行qRT-PCR进一步验证。将验证过的sRNAs进行靶mRNA预测和KEGG通路分析。评估与毒力因子相关的目标(gtfB、gtfC和spaP)和相关表型的表达水平。结果在1%和5%的葡萄糖两个库中获得了2149个候选sRNA,其中有581个sRNAs是呈差异表达的,43个得到了验证。两种葡萄糖浓度下,靶基因表达无差异。1%葡萄糖组变异链球菌的粘附率和产酸能力均高于5%葡萄糖处理组。WIG与IPS合成能力在两组无明显差异。5%葡萄糖处理组的WSG合成能力高于1%葡萄糖处理组。根据KEGG pathway分析,差异表达的sRNAs涉及到不同的通路。结论葡萄糖应激下可诱导产生sRNAs,其中的一系列sRNAs是在1%和5%的葡萄糖浓度下被特异性诱导产生的。差异表达的sRNAs可能参与调控粘附、多糖合成及其他相关通路。

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