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大规模RNA干扰筛选具有可变剪接调控蛋白

肖锐  孙涛  吴同彬  魏然  卓晓宇  付向东  张翼  
【摘要】:mRNA 的可变剪接是高等真核生物基因调控的重要方式。不同的剪接方式可以将同一基因转录生成的前体 mRNA 加工成不同的 mRNA 同源异形体,从而编码多种蛋白质,这是蛋白质组远远大于基因组的主要原因之一。人类基因有丰富的内含子(平均一个基因近8 个内含子),预测50%以上的人类基因存在可变剪接。mRNA 可变剪接调控是通过可变剪接调控蛋白结合 mRNA 前体的外显子和内含子里面的顺式作用元件而介导的,但是目前所知道的可变剪接调控因子只有一二十个,所以人们对人细胞内精细的可变剪接调控网络知之甚少。我们的研究旨在根据可变剪接调控因子具有与 RNA 特异结合功能的性质,利用 RNA 干扰技术对数据库中预测的 RNA 结合蛋白中进行逐一沉默,用可变剪接双色荧光报告系统在基因组范围内系统性筛选可变剪接调控蛋白,并初步研究其调控机制。

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