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野生和栽培大豆连锁不平衡的结构

郭凌  阎新  杨桂玲  饶琼  江玉梅  余潮  朱友林  
【摘要】:本文采用DNA序列测定方法,对野生和栽培共87份大豆材料的18个DNA片段成功地进行了序列分析,获得了总长10.649kbpDNA序列。分别在野生大豆和栽培大豆中发现了 112和58个SNPs,SNPs频率θ和p分别为2.24×10-3、1.21×10-3和2.35×10-3、1.77×10-3。分别在野生大豆和栽培大豆中发现了131和76种单倍型,单倍型多样性(H)分别为0.611和0.446。比较SNPs和单倍型在野生大豆和栽培大豆间的分布情况,发现在大豆栽培驯化过程中有大量 SNPs和单倍型丢失。丢失的SNPs和单倍型主要是稀有的,也有普通的。连锁不平衡(LD)分析发现,野生大豆在10~20kbp的范围内r2下降到0.1以下,栽培大豆在150kbp~250kbp的范围内12下降到0.1,表明野生大豆的LD强度远远地低于栽培大豆。综上所述,我们认为大豆在栽培驯化过程中遗传变异逐渐丢失,遗传多样性逐渐变小。大豆这种遗传结构的变化与遗传漂变、选择等主要因素有关,表明存在显著的瓶颈效应和选择作用。

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