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黄瓜花叶病毒花生株系CA的全序列分析

晏立英  许泽永  Marcel Prins  陈坤荣  
【摘要】:根据黄瓜花叶病毒(CMV)各条RNA链的保守序列设计引物,提取CMV花生株系(CMV-CA)感染烟草的总RNA,对该病毒基因组进行克隆,序列分析。结果表明:CMV-CA RNA1全长3356nt,RNA2全长3045nt,RNA3全长2219nt。经与CMV亚组Ⅰa,Ⅰb,Ⅱ十个株系基因组序列进行核苷酸序列同源性比较,CMV-CA与CMV亚组Ⅰ成员核苷酸序列同源性高于与CMV亚组Ⅱ成员间的同源性:对RNA 3 5’非编码区(5’NTR)、外壳蛋白(CP)核苷酸序列进行进化树分析表明CMV-CA属于CMV亚组Ⅰb。

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