稻瘟病菌组蛋白脱乙酰化酶RPD3/HDA1家族成员的生物信息学分析

【摘要】：本研究利用生物信息学方法对稻瘟病菌组蛋白脱乙酰化酶 RPD3/HDA1家族成员(HDA3001、 HDA3002和 HDA3003)的生物学功能进行研究。结果表明,HDA3001、HDA3002和 HDA3003分别位于第1条、第3条和第6条染色体上;它们编码的蛋白均含有蛋白激酶 C 磷酸化、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化、N-糖基化、N-豆蔻酰化位点4个相同的位点;HDA3001和 HDA3003均有跨膜区,而 HDA3002 无跨膜区;多序列比对发现病原菌 RPD3/HDA1家族的 HDAC 结构域高度保守;通过 cDNA 的序列推测 RPD3/HDA1家族成员编码蛋白的一级结构、二级结构和三级结构,并且预测这些基因5'上游启动子调控元件及蛋白结合位点等信息,为进一步解读 RPD3/HDA1基因家族成员的功能奠定基础。