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基于16S rDNA不同靶序列对厌氧ABR反应器微生物多样性分析的影响

魏利  马放  李成军  王博  孙伟  
【摘要】:在反硝化抑制硫酸盐还原菌的研究中,探讨了不同引物扩增16S rDNA 靶序列对厌氧 ARB 反应器的活性污泥 DGGE 图谱多样性的影响,从反应器中提取污泥总 DNA,以4 对通用引物341F/534R、968F/1401R、63F/534R、341F/926R 扩增16S rDNA 序列,对指纹图谱的分辨率和种群多样性进行分析。研究表明,采用 PBS 洗涤污泥和超声振荡有利于硫酸盐还原污泥总 DNA 提取;不同引物 DGGE 图谱分析,群落多样性存在显著的差异, 341F/534R 和968F/1401R 的靶序列分离效果较好,341F/926R 分离效果一般,63F/534R 分离的效果最差。341F/534R 的 DGGE 图谱中条带丰富,多样性最好,968F/1401R 的 DGGE 图谱次之,341F/926R 的 DGGE 图谱条带一般,63F/534R 图谱条带最少,多样性也较差。建议 DGGE 分析厌氧活性污泥样品时,同时采用引物341F/534R 和968F/1401R 是比较适宜的。

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