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磷酸化肽段质量数的分布特征

魏开华  刘锋  何昆  王杰  刘炳玉  张学敏  杨松成  
【摘要】:正基于双向电泳和液相色谱的蛋白质鉴定是蛋白质组最常用的技术,质谱谱图的好坏对鉴定的成功率起决定性作用。其中,某些不确定的修饰和非蛋白污染物是影响谱图质量的难以忽略的因素。Mann等曾经建立过“肽的可能的质量列表”,并指出存在“肽质量禁区MFZ(Mass Forbidden Zone)”, 其研究的质量范围为0-2 000 u。本文在此基础上,编写了基于Web的肽段质量数分析统计软件PMFstat,研究了0-5 000 u质量范围的胰蛋白酶酶切肽段的质量分布,并特别考察了磷酸化肽段的质量数特征。结果表明:磷酸化效应导致“肽质量禁区”明显变窄和肽质量分布峰值左移。

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