猪源O型口蹄疫病毒分离株VP1基因特征分析

【摘要】：O型口蹄疫病毒在全世界广泛流行,可分为10个亚型,在我国主要流行古典中国株(Cathay)、泛亚(Pan Asia)两种亚型毒株,而口蹄疫东南亚亚型(SEA)毒株主要在缅甸、老挝、越南等东南亚国家流行。但2009～2010年,我国部分地区出现口蹄疫疫情,经国家口蹄疫参考实验室诊断,流行毒株为口蹄疫东南亚亚型(缅甸谱系)。本研究通过对在2010年我国西南地区从猪分离鉴定的4株O型口蹄疫病毒VP1基因序列测定,采用DNAStar和Genbank中O型口蹄疫毒株VP1基因进行序列比较分析,结果表明,分离的4株O型口蹄疫病毒相互之间同源率均在97.2%以上,VP1蛋白氨基酸在198位存在特征性的变异(E→A)。运用MAGE4.0软件构建O型口蹄疫病毒进化树,结果显示,分离的4株病毒属于O型口蹄疫东南亚亚型CHA亚群。应用DNAstar软件Jameson-Wolf方法进行VP1结构蛋白的抗原性指数分析,结果以O/NC/CHA/2010株为代表的CHA亚群抗原指数与东南亚亚型差别较小,而与古典中国、泛亚两种亚型的差别较大,而目前我国使用的O型口蹄疫疫苗毒株主要是古典中国和泛亚亚型毒株。提示目前使用的两种亚型的疫苗毒株可能对该毒株的保护率有限,因此,今后应对口蹄疫疫苗毒株的选择进行一定调整。