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基于PCR的黑麦5R染色体特异分子标记开发及其区段定位

葸玮  蒋敏  汤述尧  邱玲  符书兰  唐宗祥  
【摘要】:黑麦5R染色体带有许多对小麦遗传育种起到重要作用的优良基因,例如抗白粉病和增强小麦耐寒性的基因,以及影响小麦抽穗期和减数分裂行为的基因等。开发黑麦5R染色体特异分子标记并对其进行区段定位,有利于5R染色体携带的优良基因的利用。本实验用非变性荧光原位杂交(ND-FISH)方法,从小麦品种绵阳11×黑麦Kustro的后代中,鉴定出了一套小麦-黑麦单体附加系MA1R~(KU)-7R~(KU)以及一系列5R缺失系。利用SLAF-seq测序技术,对5R单体附加系进行了测序,再利用生物信息学方法初步筛选出5R染色体特异序列,根据这些序列设计447对引物,然后利用单体附加系MA1R~(KU)-7R~(KU)开发出了76对5R染色体特异分子标记。随后利用黑麦5R单体附加系和5R缺失系将这些引物分别定位到5R染色体的5个区段。此外,再用3套小麦-黑麦附加系对这76对引物进行多态性检测,其中66对引物在5R染色体上具有多态性,10对引物在4种不同来源的5R染色体中具有保守性。

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